Abstract 16338: Dna Hypomethylation in Long Non-coding Rna Promoter During Calcific Aortic Valve Stenosis: Implication for the Notch Pathway
Notice bibliographique
Résumé
Introduction:Calcific aortic valve stenosis (CAVS) is the most common valvular heart disease. Transdifferentiation of valve interstitial cells of the aortic valve (VICs) into osteogenic cells is an important process in the pathology. However, the molecular mechanisms involved in gene expression during osteogenic transition are still poorly understood. Hypothesis:Long non-coding RNAs (lncRNAs) regulate gene expression pattern and may be involved in the osteogenic transdifferentiation during the development of the CAVS. Methods:Transcriptomic by RNA sequencing (RNA-seq) and DNA genome-wide methylation studies were performed in human aortic valves. In addition, the role of a lncRNA on the mineralization was explored and the molecular mechanisms by which it promotes osteogenic transdifferentiation was documented. Results:Transcriptomic profiling of CAVS and control valves revealed that a lncRNA was highly expressed in mineralized valves. The CpG islands in the promoter region of the gene coding this lncRNA were hypomethylated (n=23). These data were confirmed by q-PCR (n=152), fluorescence in situ hybridization (FISH) and pyrosequencing (n=60). Methylation status of the lncRNA promoter was inversely related to expression level and in isolated VICs a treatment with 5-aza-2’-deoxycytidine, which causes DNA demethylation, increased the expression of lncRNA by 2,5-fold. Knockdown or overexpression experiments showed that lncRNA play an important role in the osteogenic transdifferentiation via the Notch1 pathway. Promoter studies coupled with luciferase and chromatin immunoprecipitation (ChIP) revealed that this lncRNA interferes with the activity of Notch1 by physically interacting with the promoter. LncRNA-induced mineralization of VICs was rescued by a co-transfection of a vector encoding for the Notch intracellular domain (NICD). Conclusions:During CAVS the hypomethylation in the promoter region promotes the overexpression of a lncRNA. This lncRNA promotes the dysfunction of the Notch signaling pathway and induces the osteogenic transdifferentiation of VICs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».