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Enregistrement W2570876655 · doi:10.1182/blood.v112.11.853.853

Identification of Mir-145 and Mir-146a as Micrornas Involved in the Pathogenesis of 5q- Syndrome

2008· article· en· W2570876655 sur OpenAlexaff
Daniel T. Starczynowski, Florian Kuchenbauer, Bob Argiropoulos, Sandy Sung, Ryan D. Morin, Andrew Muranyi, Martin Hirst, Donna E. Hogge, Marco A. Marra, Richard A. Wells, Wan L. Lam, R. Keith Humphries, Aly Karsan

Notice bibliographique

RevueBlood · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHaematopoiesisBone marrowCancer researchBiologymicroRNAMyeloid leukemiaImmunologyLeukemiaThrombocytosisMegakaryocytopoiesisMyeloidMedicineStem cellMegakaryocyteGeneGeneticsPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Deletion of the long arm of chromosome 5 is the most common cytogenetic alteration in myelodysplastic syndromes and is classified as a distinct subtype of the disease (5q- syndrome). Patients with 5q- syndrome present with macrocytic anemia, variable neutropenia, normal or elevated platelet counts, and megakaryocyte dysplasia. Over time these patients progress to marrow failure or acute myeloid leukemia. The commonly deleted region in 5q- syndrome contains numerous genes that are implicated in hematopoiesis, however no single gene loss recapitulates all features of 5q- syndrome in vivo. We examined the expression of microRNAs (miR) within the deleted region of chromosome 5q and found reduced expression of miR-145 and miR-146a in patients with del (5q). Knockdown of miR-145 or miR-146a in normal mouse hematopoietic cells resulted in increased megakaryopoiesis. We identified TIRAP and TRAF6 as critical mRNA targets of miR-145 and miR-146a, respectively. Expression of TIRAP alone resulted in autoactivation of TRAF6, implicating activation of a common pathway with loss of either miR-145 or miR-146a. Transplantation of lethally-irradiated mice with marrow cells expressing retrovirally-transduced TRAF6 resulted in neutropenia, anemia, thrombocytosis, and hypolobulated megakaryocytes. Long-term follow up of chimeric mice over 12 months revealed progression in approximately half the mice to marrow failure or acute leukemia. Further experiments revealed that recapitulation of 5q- syndrome-like features were mediated by paracrine effects induced by IL-6, as well as by cell autonomous TRAF6 effects. These findings suggest that several of the features of 5q- syndrome may be secondary to loss of microRNAs within the deleted region of chromosome 5q.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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