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Enregistrement W2571086415 · doi:10.1182/blood.v110.11.3688.3688

Four Novel Mutations in the Ferrochelatase (FECH) Gene in Patients with Erythropoietic Protoporphyria (EPP).

2007· article· en· W2571086415 sur OpenAlexaff
Elena Di Pierro, Valentina Brancaleoni, Valeria Besana, S. Ausenda, Melanie Care, Maria Domenica Cappellini

Notice bibliographique

RevueBlood · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensCentre for Family Medicine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFerrochelataseErythropoietic protoporphyriaBiologyGeneticsMolecular biologyGenePorphyriaPorphobilinogen deaminasePenetranceAlleleMutationProtoporphyrinHemePhenotypeBiochemistryEnzymeAcute intermittent porphyriaEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Erythropoietic protoporphyria (EPP) is an autosomal dominant disease with incomplete penetrance, due to reduced activity of ferrochelatase (FECH), a mitochondrial enzyme that catalyzes the insertion of iron in the protoporphyrin molecule in the final step of the heme biosynthetic pathway. The disease is biochemically characterized by increased protoporphyrins in erythrocytes, plasma and faeces and normal levels in urine. The clinical manifestations have a childhood onset, characterized by mild to moderate cutaneous photosensitivity, mild anemia and, in 5–10% of the cases, by progressive hepatic failure. Diagnosis of EPP can be supported by the simple measurement with flow citometry of fluorescent erythrocytes in peripheral blood. The phenotype of EPP results from coinheritance of a mutated allele and a wild-type low expressed allele of the FECH gene that spans about 45 kb on the long arm of chromosome 18. The FECH gene encodes for a precursor of 423 amino acid residues that is targeted to the matrix side of the inner mitochondrial membrane via a 62 amino acid cleavable leader sequence. A single promoter directs both housekeeping and erythroid expression, but two polyadenylation sites produce two mRNAs of different length. The molecular analysis of FECH gene has allowed the identification of more than 100 different mutations responsible for EPP, showing a high genetic heterogeneity. Aim of this study was to search for molecular abnormalities in four patients with clinical and biochemical signs of EPP. Molecular analysis was performed by PCR and direct sequencing of the promoter, the entire coding region and the splicing junctions of the gene. In patients who remained negative for mutations, DNA analysis was completed by long-PCR and chromosome walking. In this study four different molecular defects have been identified: two missense mutations and two large deletions in the first region of gene. One A>G substitution at nucleotide 362 in exon 4 resulting in a Glu to Gly amino acid substitution at position 121; one change C>T in position 782 of exon 7 causing a Ser 261Phe substitution; the c.1-7887_67+2422del10376bp and the c.1-9628_67+2871del12566bp. Even though with different breakpoints, both deletions include a portion of upstream intergenic region, the promoter, the exon 1 and a portion of intron 1 of the FECH gene preventing the expression of the mutated allele. This deletions are probably caused by unequal intragenic recombination between ALU sequences which have been found close to the breakpoints. Recently others deletions involving ALU sequences were described suggesting that large deletions can affect the FECH gene and cause of EPP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
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Résumé présentoui

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