MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2571162532 · doi:10.1182/blood.v118.21.2562.2562

GATA1 mutations Outside the Blast Cell Population in Transient Leukemia of Down Syndrome

2011· article· en· W2571162532 sur OpenAlexaff
Jian Chen, Agnieszka A. Wendorff, Yue Li, Johann Hitzler

Notice bibliographique

RevueBlood · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGATA1HaematopoiesisBiologyPopulationMolecular biologyMyeloidclone (Java method)LeukemiaMyelopoiesisCD34Precursor cellMyeloid leukemiaImmunologyStem cellCellCell biologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 2562 Background. Transient leukemia (TL), a disorder of fetal hematopoiesis, occurs in approximately 10% of infants with Down syndrome and in one fifth of cases is followed by the development of acute myeloid leukemia. The diagnosis of TL is based on the detection of a spontaneously resolving population of blasts in the peripheral blood of newborns with DS and, more recently, the detection of clone-specific somatic mutations of the hematopoietic transcription factor GATA1. The alternative terms for this condition, transient myeloproliferative disorder (TMD) and transient abnormal myelopoiesis (TAM), reflect the observation that the peripheral blood of affected infants frequently shows an expansion of immature granulocytic precursor cells at various stages of development as well as nucleated erythroid precursors in addition to a population of blast cells. We hypothesized that the immature myeloid precursor cells observed in TL arise from the same hematopoietic cell clone that is defined by the specific GATA1 mutation found in TL blasts. Methods. Cryopreserved mononuclear cells from peripheral blood samples of three male infants with TL of Down syndrome were stained at a density of 106 cells/100ul with the following antibodies: CD45-Alexa Flour 700, CD61-PE, CD11b-PE-Cy5, CD235a-PE-Cy7, CD3-APC, CD34-APC-Cy7, CD15-Pacific Blue. In addition, aliquots of these cell populations were fixed, permeabilized and stained with for intracellular myeloperoxidase (MPO-FITC). Fractions of cells corresponding to different hematopoietic lineages were prepared by fluorescence activated cell sorting (FACSAriaII, BD Biosciences, San Jose, CA) both as bulk populations and single cells (sorted into 96-well plates). Morphology of sorted cell populations was determined by Giemsa staining. Lineage-specific hematopoietic colonies were cultured from primary mononuclear cell samples in a standard CFC assay. DNA of sorted bulk and single cell populations as well as individual lineage-specific hematopoietic colonies was used to detect GATA1 mutations in exon 2 by PCR, restriction enzyme analysis or sequencing of PCR products, or nested PCR. The location of the GATA1 gene on the X chromosome and the use of samples derived from males meant that wild type GATA1 alleles were not derived from TL cells. Results. Primary TL blood samples could be fractionated in a blast cell (CD45+CD34+and/or CD61+), erythroid (CD45-CD235a+), immature myeloid (CD45+CD15+MPO+) and lymphoid (CD45+CD3+) cell population. Cell morphology was consistent with this sorting strategy. The cell fraction designed to enrich TL blasts in all cases showed the presence of cells harboring only the mutant GATA1 allele indicating a high degree of purity of the blast fraction. As expected, the lymphoid cell populations contained in the CD3+ fractions exclusively harbored wild type alleles. Similarly, both sorted erythroid cell populations and individual erythroid colonies (Bfu-E) derived from unsorted input cells harbored only wild type GATA1 alleles. In contrast, CD15+ and/or MPO+ myeloid cell fractions consistently showed the presence of both mutant and wild type GATA1 alleles. Quantification by single cell PCR is in progress. Conclusion. Somatic GATA1 mutations which result in the translation of a N-terminally truncated mutant protein (GATA1s), are pathognomonic for TL and myeloid leukemia of Down syndrome. Published data do not determine if the cell clone harboring GATA1 mutations in TL extends beyond the population of blast cells and megakaryocytic lineage. We confirmed the presence of GATA1 mutations in TL blasts and their expected absence from lymphoid cell populations. The absence of mutations from cells of erythroid lineage suggests that the altered GATA1 function induced by mutations found in TL is incompatible with erythroid differentiation. The detection of clone-specific GATA1 mutations in myeloid cells expressing MPO was unexpected and raises the possibility that either the progenitor cells giving rise to TL blasts or the blasts themselves retain myeloid lineage differentiation potential. The finding lends support to definitions of TL and myeloid leukemia in Down syndrome that are based on the specific mutational and cellular mechanism and transcend a megakaryoblastic blast phenotype. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood→Même sujetAcute Myeloid Leukemia Research→Travaux en français237 207→