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Enregistrement W2571432806 · doi:10.1093/ajh/hpw167

High Frequency of Variants of Candidate Genes in Black Africans with Low Renin-Resistant Hypertension

2016· article· en· W2571432806 sur OpenAlexafffund
Erika Jones, J. David Spence, Adam D. McIntyre, Justus Nondi, Kennedy Gogo, Adeseye A. Akintunde, Daniel G. Hackam, Brian Rayner

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Hypertension · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesGrand Challenges Canada
Mots-clésMedicineResistant hypertensionGeneInternal medicineBlood pressureRenin–angiotensin systemCandidate geneCardiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Black subjects tend to retain salt and water, be more sensitive to aldosterone, and have suppression of plasma renin activity. Variants of the renal sodium channel (ENaC, SCNN1B) account for approximately 6% of resistant hypertension (RHT) in Blacks; other candidate genes may be important. METHODS: Six candidate genes associated with low renin-resistant hypertension were sequenced in Black Africans from clinics in Kenya and South Africa. CYP11B2 was sequenced if the aldosterone level was high (primary aldosteronism phenotype); SCNN1B, NEDD4L, GRK4, UMOD, and NPPA genes were sequenced if the aldosterone level was low (Liddle phenotype). RESULTS: There were 14 nonsynonymous variants (NSVs) of CYP11B2: 3 previously described and associated with alterations in aldosterone synthase production (R87G, V386A, and G435S). Out of 14, 9 variants were found in all 9 patients sequenced. There were 4 NSV of GRK4 (R65L, A116T, A142V, V486A): at least one was found in all 9 patients; 3 were previously described and associated with hypertension. There were 3 NSV of SCNN1B (R206Q, G442V, and R563Q); 2 previously described and 1 associated with hypertension. NPPA was found to have 1 NSV (V32M), not previously described and NEDD4L did not have any variants. UMOD had 3 NSV: D25G, L180V, and T585I. CONCLUSIONS: A phenotypic approach to investigating the genetic architecture of RHT uncovered a surprisingly high yield of variants in candidate genes. These preliminary findings suggest that this novel approach may assist in understanding the genetic architecture of RHT in Blacks and explain their two fold risk of stroke.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,897
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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