Characterization of Clinical Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Isolates From Canadian Hospitals, 2010–2015
Notice bibliographique
Résumé
Background. The Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program (CNISP) has been performing prospective laboratory-based surveillance for MRSA infections since 1995. In this study we investigated the changes in MRSA genotypes and antimicrobial susceptibilities from 2010 to 2015. Methods. Clinical (non-screening) MRSA isolates from patients in 59 acute-care Canadian hospitals were included in the study. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) epidemic type was assigned using spa typing. Spa types t002 and t008 correspond to CMRSA2 (USA100/800) and CMRSA10 (USA300), respectively. Antibiotic susceptibilities were determined by broth microdilution in accordance with CLSI guidelines. Results. A total of 3589 MRSA isolates were submitted: 49.1% were CMRSA2 and 35.5% CMRSA10. Infection sites were as follows: 48.4% bloodstream infections, 18.6% skin/soft tissue, 11.3% respiratory, 9.2% surgical site, 7.9% urine and 4.5% other sites. CMRSA10 was more likely to be recovered from skin/soft tissue, while CAMRSA2 from all other sites. The proportion of CMRSA10 isolates increased from 28.1% in 2010 to 42.2% in 2015 (p < 0.001), whereas CMRSA2 decreased (Figure 1A). Regional differences in genotype distribution were noted: CMRSA10 was predominant in western Canada (Figure 1A). Antimicrobial resistance profiles are shown in Figure 1B. Resistance to clindamycin decreased (from 93.1% in 2010 to 58.8% 2015; p < 0.001), whereas resistance to fusidic acid and high-level resistance to mupirocin increased (6.8% to 12.3%, p < 0.001; and 0.9% to 5.6%, p = 0.001; respectively). Figure 1. A. PFGE type per year/region (CMRSA2 blue; CMRSA10 red). B. CMRSA2/CMRSA10 antibiogram. CLD, clindamycin; ERY, erythromycin; CIP, ciprofloxacin; GEN, gentamicin; LIN, linezolid; RIF, rifampin; TET, tetracycline; SXT, trimethoprim-sulfamethoxazole; VAN, vancomycin; TIG, tigecycline; FUS, fusidic acid; MUP, mupirocin; DAP, daptomycin. Overall resistance rate is shown (blue line). Conclusion. There has been a change in genotypes over the past few years with an increased incidence of CMRSA10 as a cause of infection in Canadian hospitals. This has been associated with increased susceptibility to clindamycin. Resistance to trimethoprim-sulfamethoxazole and tetracycline remains stable and low. Disclosures. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».