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Enregistrement W2572288598 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.1025

α-basic-crystallin expression in basal-like breast cancer and its association with brain metastasis

2009· article· en· W2572288598 sur OpenAlexaff
Hagen F. Kennecke, David Voduc, Suet Yi Leung, Vincent L. Cryns, Charles M. Perou, Torsten O. Nielsen, Maggie C.U. Cheang

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerBrain metastasisTissue microarrayCancerMetastasisOncologyPathologyCytokeratinInternal medicineMetastatic breast cancerImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1025 Background: Basal-like breast cancers are high grade tumors with poor prognosis, having propensity for brain and lung metastasis (Perou et al. Nature 406:747–52, 2000, Cheang et al. Clin Cancer Res 14:1368–76, 2008, Luck et al. Clin Oncol (R Coll Radiol) 20:40–5, 2008). α-basic-crystallin (αBC), a small heat shock protein with anti-apoptotic and oncogenic activity, is expressed in about half of basal-like breast cancers but only 6% of other types (Moyano et al. J Clin Invest 116:261–70, 2006). Here we investigate the association of αBC with sites of distant metastasis in a large cohort of breast cancer patients. Methods: Our cohort consists of 4046 early invasive breast cancers referred to the British Columbia Cancer Agency from 1986 to 1992. Archival paraffin tissue blocks were used to construct tissue microarrays. Breast cancer subtypes were defined using a surrogate of six immunohistochemical markers: ER, PR, HER2, Ki-67, epidermal growth factor receptor and cytokeratin 5/6. αBC immunostaining was scored by pre-established, published criteria. All documented sites of distant metastasis were abstracted by chart review according to predefined categories. The null hypothesis was tested using chi-square and Fisher's Exact tests; all tests were two-sided. Results: Among 3,248 cases with interpretable αBC data, 11% were αBC +. Among patients who developed distant metastatic disease, the 10-yr BCSS survival in αBC+ and - tumors was 12% and 29%. Sites of metastatic disease included: brain (15%), lung (35%), liver (35%) and bone (65%). Brain metastasis was significantly more common among αBC positive tumors (Fisher's Exact test p<10e-8). Basal-like tumors with brain metastasis commonly co-expressed αBC (Chi-square p=0.006). Conclusion: αBC is significantly associated with brain metastasis, particularly among basal breast cancers. These findings suggested that αBC may be involved in tumor cell metastasis and may allow early identification of a subset of patients at particularly high risk of brain metastasis. [Table: see text] No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,374 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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