Interobserver Agreement in Endometrial Carcinoma Histotype Diagnosis Varies Depending on The Cancer Genome Atlas (TCGA)-based Molecular Subgroup
Notice bibliographique
Résumé
The Cancer Genome Atlas recently identified a genomic-based molecular classification of endometrial carcinomas, with 4 molecular categories: (1) ultramutated (polymerase epsilon [POLE] mutated), (2) hypermutated (microsatellite instability), (3) copy number abnormalities-low, and (4) copy number abnormalities-high. Two studies have since proposed models to classify endometrial carcinomas into 4 molecular subgroups, modeled after The Cancer Genome Atlas, using simplified and more clinically applicable surrogate methodologies. In our study, 151 endometrial carcinomas were molecularly categorized using sequencing for the exonuclease domain mutations (EDM) of POLE, and immunohistochemistry for p53 and mismatch repair (MMR) proteins. This separated cases into 1 of 4 groups: (1) POLE EDM, (2) MMR-D, (3) p53 wildtype (p53 wt), or (4) p53 abnormal (p53 abn). Seven gynecologic pathologists were asked to assign each case to one of the following categories: grade 1 to 2 endometrioid carcinoma (EC), grade 3 EC, mucinous, serous carcinoma (SC), clear cell, dedifferentiated, carcinosarcoma, mixed, and other. Consensus diagnosis among all 7 pathologists was highest in the p53 wt group (37/41, 90%), lowest in the p53 abn group (14/36, 39%), and intermediate in the POLE EDM (22/34, 65%) and MMR-D groups (23/40, 58%). Although the majority of p53 wt endometrial carcinomas are grade 1 to 2 EC (sensitivity: 90%), fewer than half of grade 1 to 2 EC fell into the p53 wt category (positive predictive value: 42%). Pure SC almost always resided in the p53 abn group (positive predictive value: 96%), but it was insensitive as a marker of p53 abn (sensitivity 64%) and the reproducibility of diagnosing SC was suboptimal. The limitations in the precise histologic classification of endometrial carcinomas highlights the importance of an ancillary molecular-based classification scheme.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».