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Enregistrement W2572403411 · doi:10.1038/srep40349

Characterization of two polyvalent phages infecting Enterobacteriaceae

2017· article· en· W2572403411 sur OpenAlexaff
Sana Hamdi, Geneviève M. Rousseau, Simon J. Labrie, Denise M. Tremblay, Rim Kourda, Karim Ben Slama, Sylvain Moineau

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSiphoviridaeBiologyMicrobiologyShigellaMyoviridaeBacteriophageEnterobacteriaceaeShigella flexneriLytic cycleShigella dysenteriaeVirulencePhage typingPhage therapyVirologyBacteriaSalmonellaEscherichia coliSerotypeVirusGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteriophages display remarkable genetic diversity and host specificity. In this study, we explore phages infecting bacterial strains of the Enterobacteriaceae family because of their ability to infect related but distinct hosts. We isolated and characterized two novel virulent phages, SH6 and SH7, using a strain of Shigella flexneri as host bacterium. Morphological and genomic analyses revealed that phage SH6 belongs to the T1virus genus of the Siphoviridae family. Conversely, phage SH7 was classified in the T4virus genus of the Myoviridae family. Phage SH6 had a short latent period of 16 min and a burst size of 103 ± 16 PFU/infected cell while the phage SH7 latent period was 23 min with a much lower burst size of 26 ± 5 PFU/infected cell. Moreover, phage SH6 was sensitive to acidic conditions (pH < 5) while phage SH7 was stable from pH 3 to 11 for 1 hour. Of the 35 bacterial strains tested, SH6 infected its S. flexneri host strain and 8 strains of E. coli. Phage SH7 lysed additionally strains of E. coli O157:H7, Salmonella Paratyphi, and Shigella dysenteriae. The broader host ranges of these two phages as well as their microbiological properties suggest that they may be useful for controlling bacterial populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,401
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations133
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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