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Enregistrement W2574432813 · doi:10.1038/ncomms13624

Novel genetic loci associated with hippocampal volume

2017· review· en· W2574432813 sur OpenAlexaff
Derrek P. Hibar, Hieab H.H. Adams, Neda Jahanshad, Ganesh Chauhan, Jason L. Stein, Edith Hofer, Miguel E. Rentería, Joshua C. Bis, Alejandro Arias Vásquez, M. Kamran Ikram, Sylvane Desrivières, Meike W. Vernooij, Lucija Abramovic, Saud Alhusaini, Najaf Amin, Micael Andersson, Konstantinos Arfanakis, Benjamin S. Aribisala, Nicola J. Armstrong, Lavinia Athanasiu, Tomas Axelsson, Ashley Beecham, Alexa Beiser, Manon Bernard, Susan H. Blanton, Marc M. Bohlken, Marco P. Boks, Janita Bralten, Adam M. Brickman, Owen Carmichael, M. Mallar Chakravarty, Qiang Chen, Christopher R. K. Ching, Vincent Chouraki, Gabriel Cuéllar-Partida, Fabrice Crivello, Anouk den Braber, Nhat Trung Doan, Stefan Ehrlich, Sudheer Giddaluru, Aaron L. Goldman, Rebecca F. Gottesman, O. Grimm, Michael Griswold, Tulio Guadalupe, Boris A. Gutman, Johanna Haß, Unn K. Haukvik, David Hoehn, Avram J. Holmes, Martine Hoogman, Deborah Janowitz, Tianye Jia, Kjetil Nordbø Jørgensen, Nazanin Karbalai, Dalia Kasperavičiūtė, Sungeun Kim, Marieke Klein, Bernd Kraemer, Phil H. Lee, David C. Liewald, Lorna M. Lopez, Michelle Luciano, Christine Macare, André F. Marquand, Mar Matarín, Karen A. Mather, Manuel Mattheisen, David R. McKay, Yuri Milaneschi, Susana Muñoz Maniega, Kwangsik Nho, Allison C. Nugent, Paul Nyquist, Loes M. Olde Loohuis, Jaap Oosterlaan, Martina Papmeyer, Lukas Pirpamer, Benno Pütz, Adaikalavan Ramasamy, Jennifer S. Richards, Shannon L. Risacher, Roberto Roiz-Santiañez, Nanda Rommelse, Stefan Ropele, Emma Rose, Natalie A. Royle, Tatjana Rundek, Philipp G. Sämann, Arvin Saremi, Claudia L. Satizábal, Lianne Schmaal, Andrew J. Schork, Li Shen, Jean Shin, Elena Shumskaya, Albert V. Smith, Emma Sprooten, Lachlan T. Strike, Alexander Teumer, Diana Tordesillas‐Gutiérrez, Roberto Toro, Daniah Trabzuni, Stella Trompet, Dhananjay Vaidya, Jeroen van der Grond, Sven J. van der Lee, Dennis van der Meer, Marjolein M. J. van Donkelaar, Kristel R. van Eijk, Theo G.M. van Erp, Daan van Rooij, Esther Walton, Lars T. Westlye, Christopher D. Whelan, B. Gwen Windham, Anderson M. Winkler, Katharina Wittfeld, Girma Woldehawariat, Christiane Wolf, Thomas Wolfers, Lisa R. Yanek, Jingyun Yang, Alex Zijdenbos, Marcel P. Zwiers, Ingrid Agartz, Laura Almasy, David Ames, Philippe Amouyel, Ole A. Andreassen, Sampath Arepalli, Amelia A. Assareh, Sandra Barral, Mark E. Bastin, Diane M. Becker, James T. Becker, David A. Bennett, John Blangero, Hans van Bokhoven, Dorret I. Boomsma, Henry Brodaty, Rachel M. Brouwer, Han G. Brunner, Randy L. Buckner, Jan K. Buitelaar, Kazima Bulayeva, Wiepke Cahn, Vince D. Calhoun, Dara M. Cannon, Gianpiero L. Cavalleri, Ching‐Yu Cheng, Sven Cichon, Mark Cookson, Aiden Corvin, Benedicto Crespo‐Facorro, Joanne E. Curran, Michael Czisch, Anders M. Dale, Gareth E. Davies, Anton J. M. de Craen, Eco J. C. de Geus, Philip L. De Jager, Greig I. de Zubicaray, Ian J. Deary, Stéphanie Debette, Charles DeCarli, Norman Delanty, Chantal Depondt, Anita L. DeStefano, Allissa Dillman, Srdjan Djurovic, Gary Donohoe, Wayne C. Drevets, Ravi Duggirala, Thomas D. Dyer, Christian Enzinger, Susanne Erk, Thomas Espeseth, Iryna O. Fedko, Guillén Fernández, Luigi Ferrucci, Simon E. Fisher, Debra Fleischman, Ian Ford, Myriam Fornage, Tatiana M. Foroud, Peter T. Fox, Clyde Francks, Masaki Fukunaga, J. Raphael Gibbs, David C. Glahn, Randy L. Gollub, Harald H.H. Göring, Robert C. Green, Oliver Gruber, Vilmundur Guðnason, Sebastian Guelfi, Asta K. Håberg, Narelle K. Hansell, John Hardy, Catharina A. Hartman, Ryota Hashimoto, Katrin Hegenscheid, Andreas Heinz, Stéphanie Le Hellard, Dena Hernández, Dirk J. Heslenfeld, Beng‐Choon Ho, Pieter J. Hoekstra, Wolfgang Hoffmann, Albert Hofman, Georg Homuth, Norbert Hosten, Jouke‐Jan Hottenga, Matthew J. Huentelman, Hilleke E. Hulshoff Pol, Masashi Ikeda, Clifford R. Jack, Mark Jenkinson, Robert Johnson, Erik G. Jönsson, J. Wouter Jukema, René S. Kahn, Ryota Kanai, Iwona Kłoszewska, David S. Knopman, Peter Kochunov, John B. Kwok, Stephen M. Lawrie, Hervé Lemaître, Xinmin Liu, Dan L. Longo, Oscar L. Lopez, Simon Lovestone, Oliver Martinez, Jean‐Luc Martinot, Venkata S. Mattay, Colm McDonald, Andrew M. McIntosh, Francis J. McMahon, Katie L. McMahon, Patrizia Mecocci, Ingrid Melle, Andreas Meyer‐Lindenberg, Sebastian Mohnke, Grant W. Montgomery, Derek W. Morris, Thomas H. Mosley, Thomas W. Mühleisen, Bertram Müller‐Myhsok, Michael A. Nalls, Matthias Nauck, Thomas E. Nichols, Wiro J. Niessen, Markus M. Nöthen, Lars Nyberg, Kazutaka Ohi, Rene L. Olvera, Roel A. Ophoff, Massimo Pandolfo, Tomáš Paus, Zdenka Pausová, Brenda W.J.H. Penninx, G. Bruce Pike, Steven G. Potkin, Bruce M. Psaty, Simone Reppermund, Marcella Rietschel, Joshua L. Roffman, Nina Romanczuk‐Seiferth, Jerome I. Rotter, Mina Ryten, Ralph L. Sacco, Perminder S. Sachdev, Andrew J. Saykin, Reinhold Schmidt, Helena Schmidt, Peter R. Schofield, Sigurdur Sigursson, Andrew Simmons, Andrew Singleton, Sanjay M. Sisodiya, Colin Smith, Jordan W. Smoller, Hilkka Soininen, Vidar M. Steen, David J. Stott, Jessika E. Sussmann, Anbupalam Thalamuthu, Arthur W. Toga, Bryan J. Traynor, Juan C. Troncoso, Magda Tsolaki, Christophe Tzourio, André G. Uitterlinden, Maria C. Valdés Hernández, Marcel van der Brug, Aad van der Lugt, Nic J.A. van der Wee, Neeltje E. M. van Haren, Dennis van ‘t Ent, Marie‐José van Tol, Badri N. Vardarajan, Bruno Vellas, Dick J. Veltman, Henry Völzke, Henrik Walter, Joanna M. Wardlaw, Thomas H. Wassink, Michael E. Weale, D.R. Weinberger, Michael W. Weiner, Wei Wen, Eric Westman, Tonya White, Tien Yin Wong, Clinton B. Wright, Ronald H. Zielke, Alan B. Zonderman, Nicholas G. Martin, Cornelia M. van Duijn, Margaret J. Wright, W. T. Longstreth, Günter Schumann, Hans J. Grabe, Barbara Franke, Lenore J. Launer, Sarah E. Medland, Sudha Seshadri, Paul M. Thompson, M. Arfan Ikram

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensBaycrest HospitalBioPhage Pharma (Canada)SickKids FoundationMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of TorontoCanada Research ChairsUniversity of CalgaryDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringVifor PharmaNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeParkinson's UKLundbeckfondenNational Center for Advancing Translational SciencesWellcome Trust
Mots-clésHippocampal formationVolume (thermodynamics)Computational biologyBiologyNeuroscienceComputer sciencePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The hippocampal formation is a brain structure integrally involved in episodic memory, spatial navigation, cognition and stress responsiveness. Structural abnormalities in hippocampal volume and shape are found in several common neuropsychiatric disorders. To identify the genetic underpinnings of hippocampal structure here we perform a genome-wide association study (GWAS) of 33,536 individuals and discover six independent loci significantly associated with hippocampal volume, four of them novel. Of the novel loci, three lie within genes ( ASTN2 , DPP4 and MAST4 ) and one is found 200 kb upstream of SHH . A hippocampal subfield analysis shows that a locus within the MSRB3 gene shows evidence of a localized effect along the dentate gyrus, subiculum, CA1 and fissure. Further, we show that genetic variants associated with decreased hippocampal volume are also associated with increased risk for Alzheimer’s disease ( r g =−0.155). Our findings suggest novel biological pathways through which human genetic variation influences hippocampal volume and risk for neuropsychiatric illness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations335
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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