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Enregistrement W2574521899 · doi:10.1371/journal.pone.0169847

Genome-Wide Immune Modulation of TLR3-Mediated Inflammation in Intestinal Epithelial Cells Differs between Single and Multi-Strain Probiotic Combination

2017· article· en· W2574521899 sur OpenAlexaff
Chad W. MacPherson, Padmaja Shastri, Olivier Mathieu, Thomas A. Tompkins, Pierre Burguière

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensOntario Tech UniversityLallemand (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBifidobacterium breveBiologyBifidobacterium bifidumImmune systemProbioticMicroarray analysis techniquesInflammationCXCL1CXCL10ChemokineBifidobacterium longumMicrobiologyCell biologyBifidobacteriumLactobacillusGene expressionImmunologyGeneLactobacillus acidophilusGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome-wide transcriptional analysis in intestinal epithelial cells (IEC) can aid in elucidating the impact of single versus multi-strain probiotic combinations on immunological and cellular mechanisms of action. In this study we used human expression microarray chips in an in vitro intestinal epithelial cell model to investigate the impact of three probiotic bacteria, Lactobacillus helveticus R0052 (Lh-R0052), Bifidobacterium longum subsp. infantis R0033 (Bl-R0033) and Bifidobacterium bifidum R0071 (Bb-R0071) individually and in combination, and of a surface-layer protein (SLP) purified from Lh-R0052, on HT-29 cells' transcriptional profile to poly(I:C)-induced inflammation. Hierarchical heat map clustering, Set Distiller and String analyses revealed that the effects of Lh-R0052 and Bb-R0071 diverged from those of Bl-R0033 and Lh-R0052-SLP. It was evident from the global analyses with respect to the immune, cellular and homeostasis related pathways that the co-challenge with probiotic combination (PC) vastly differed in its effect from the single strains and Lh-R0052-SLP treatments. The multi-strain PC resulted in a greater reduction of modulated genes, found through functional connections between immune and cellular pathways. Cytokine and chemokine analyses based on specific outcomes from the TNF-α and NF-κB signaling pathways revealed single, multi-strain and Lh-R0052-SLP specific attenuation of the majority of proteins measured (TNF-α, IL-8, CXCL1, CXCL2 and CXCL10), indicating potentially different mechanisms. These findings indicate a synergistic effect of the bacterial combinations relative to the single strain and Lh-R0052-SLP treatments in resolving toll-like receptor 3 (TLR3)-induced inflammation in IEC and maintaining cellular homeostasis, reinforcing the rationale for using multi-strain formulations as a probiotic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,682
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,160 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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