Genome-Wide Immune Modulation of TLR3-Mediated Inflammation in Intestinal Epithelial Cells Differs between Single and Multi-Strain Probiotic Combination
Notice bibliographique
Résumé
Genome-wide transcriptional analysis in intestinal epithelial cells (IEC) can aid in elucidating the impact of single versus multi-strain probiotic combinations on immunological and cellular mechanisms of action. In this study we used human expression microarray chips in an in vitro intestinal epithelial cell model to investigate the impact of three probiotic bacteria, Lactobacillus helveticus R0052 (Lh-R0052), Bifidobacterium longum subsp. infantis R0033 (Bl-R0033) and Bifidobacterium bifidum R0071 (Bb-R0071) individually and in combination, and of a surface-layer protein (SLP) purified from Lh-R0052, on HT-29 cells' transcriptional profile to poly(I:C)-induced inflammation. Hierarchical heat map clustering, Set Distiller and String analyses revealed that the effects of Lh-R0052 and Bb-R0071 diverged from those of Bl-R0033 and Lh-R0052-SLP. It was evident from the global analyses with respect to the immune, cellular and homeostasis related pathways that the co-challenge with probiotic combination (PC) vastly differed in its effect from the single strains and Lh-R0052-SLP treatments. The multi-strain PC resulted in a greater reduction of modulated genes, found through functional connections between immune and cellular pathways. Cytokine and chemokine analyses based on specific outcomes from the TNF-α and NF-κB signaling pathways revealed single, multi-strain and Lh-R0052-SLP specific attenuation of the majority of proteins measured (TNF-α, IL-8, CXCL1, CXCL2 and CXCL10), indicating potentially different mechanisms. These findings indicate a synergistic effect of the bacterial combinations relative to the single strain and Lh-R0052-SLP treatments in resolving toll-like receptor 3 (TLR3)-induced inflammation in IEC and maintaining cellular homeostasis, reinforcing the rationale for using multi-strain formulations as a probiotic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».