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Enregistrement W2575820504 · doi:10.1109/jbhi.2017.2652449

Statistical Shape Modeling of the Left Ventricle: Myocardial Infarct Classification Challenge

2017· article· en· W2575820504 sur OpenAlexaff
Avan Suinesiaputra, Jan D’hooge, Nicolás Duchateau, Jan Ehrhardt, Alejandro F. Frangi, Ali Gooya, Vicente Grau, Karim Lekadir, Allen Lu, Anirban Mukhopadhyay, İlkay Öksüz, Pierre Ablin, Nripesh Parajuli, Xavier Pennec, Marco Pereañez, Catarina Pinto, Paolo Piras, Marc-Michel Rohe, Daniel Rueckert, Dennis Säring, Maxime Sermesant, Kaleem Siddiqi, Xènia Albà, Mahdi Tabassian, Luciano Teresi, Sotirios A. Tsaftaris, Matthias Wilms, Alistair A. Young, Xing-Yu Zhang, Pau Medrano−Gracia, Martino Alessandrini, Jack Allen, Wenjia Bai, Serkan Çimen, Peter Claes, Brett R. Cowan

Notice bibliographique

RevueIEEE Journal of Biomedical and Health Informatics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Function and Risk Factors
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilMedical Research CouncilAuckland Medical Research FoundationBritish Heart Foundation
Mots-clésReceiver operating characteristicStatistical modelArtificial intelligenceMyocardial infarctionComputer scienceVentricleTest setPattern recognition (psychology)Set (abstract data type)Statistical powerStatistical hypothesis testingMedicineMachine learningCardiologyStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Statistical shape modeling is a powerful tool for visualizing and quantifying geometric and functional patterns of the heart. After myocardial infarction (MI), the left ventricle typically remodels in response to physiological challenges. Several methods have been proposed in the literature to describe statistical shape changes. Which method best characterizes left ventricular remodeling after MI is an open research question. A better descriptor of remodeling is expected to provide a more accurate evaluation of disease status in MI patients. We therefore designed a challenge to test shape characterization in MI given a set of three-dimensional left ventricular surface points. The training set comprised 100 MI patients, and 100 asymptomatic volunteers (AV). The challenge was initiated in 2015 at the Statistical Atlases and Computational Models of the Heart workshop, in conjunction with the MICCAI conference. The training set with labels was provided to participants, who were asked to submit the likelihood of MI from a different (validation) set of 200 cases (100 AV and 100 MI). Sensitivity, specificity, accuracy and area under the receiver operating characteristic curve were used as the outcome measures. The goals of this challenge were to (1) establish a common dataset for evaluating statistical shape modeling algorithms in MI, and (2) test whether statistical shape modeling provides additional information characterizing MI patients over standard clinical measures. Eleven groups with a wide variety of classification and feature extraction approaches participated in this challenge. All methods achieved excellent classification results with accuracy ranges from 0.83 to 0.98. The areas under the receiver operating characteristic curves were all above 0.90. Four methods showed significantly higher performance than standard clinical measures. The dataset and software for evaluation are available from the Cardiac Atlas Project website1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,043

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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