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Enregistrement W2575907954 · doi:10.1055/s-0034-1384141

Analysis of Molecular Networks Uncovers Potential Targets in Vestibular Schwannoma

2014· article· en· W2575907954 sur OpenAlexaff
Boris Krischek, S. Agnihotri, Isabel Gugel, Marc Remke, A. Bornemann, G. Pantazis, Stephen C. Mack, David Shih, Nesrin Sabha, Michael D. Taylor, Gelareh Zadeh, Marcos Tatagiba

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurological Surgery Part B Skull Base · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMeningioma and schwannoma management
Établissements canadiensToronto Western HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSchwannomaPI3K/AKT/mTOR pathwayVestibular systemCancer researchProtein kinase BBiologyGene expression profilingMedicineGeneNeuroscienceSignal transductionCell biologyPathologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Understanding molecular pathway mechanisms of the formation of vestibular schwannoma may lead to potential therapeutic targets. Study Design: We performed gene expression profiling of 49 schwannomas (36 sporadic and 13 NF2-associated cases) and 7 normal control vestibular nerves. Results: We identified over 4,000 differentially expressed genes between control and schwannoma with network analysis uncovering proliferation and antiapoptotic pathways previously not implicated in vestibular schwannomas. Using several distinct clustering technologies, we could not reproducibly identify subtypes of schwannomas suggesting that our schwannoma cohort was molecularly distinct from normal tissue yet highly similar among themselves. At the molecular level the PI3K/AKT/mTOR signaling network was overexpressed in our schwannoma cohort and evaluated for therapeutic targeting. Testing compounds BEZ235 and PKI-587 both novel dual inhibitors of PI3K and mTOR attenuated tumor growth in a preclinical cell line model of schwannoma (HEI-293). In vitro findings demonstrated that ablation of the PI3K/AKT/mTOR pathway with next generation inhibitors lead to decreased cell viability and increased cell death. Conclusion: The discovery of novel molecular targets in vestibular schwannoma by transcriptional profiling as compared with appropriate controls may lead to effective therapeutic strategies and shed insight into the molecular ontogeny of this tumor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,200
Score d'incertitude au seuil0,657

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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