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Enregistrement W2576591352 · doi:10.1093/pcp/pcw224

Multiscale Structural Analysis of Plant ER–PM Contact Sites

2017· article· en· W2576591352 sur OpenAlexafffund
Heather E. McFarlane, Eun Kyoung Lee, Laura S. van Bezouwen, Bradford Ross, Abel Rosado, Lacey Samuels

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEndoplasmic reticulumCell biologyGreen fluorescent proteinArabidopsisBiophysicsContext (archaeology)ChemistryBiologyMaterials scienceBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Membrane contact sites are recognized across eukaryotic systems as important nanostructures. Endoplasmic reticulum (ER)-plasma membrane (PM) contact sites (EPCS) are involved in excitation-contraction coupling, signaling, and plant responses to stress. In this report, we perform a multiscale structural analysis of Arabidopsis EPCS that combines live cell imaging, quantitative transmission electron microscopy (TEM) and electron tomography over a developmental gradient. To place EPCS in the context of the entire cortical ER, we examined green fluorescent protein (GFP)-HDEL in living cells over a developmental gradient, then Synaptotagmin1 (SYT1)-GFP was used as a specific marker of EPCS. In all tissues examined, young, rapidly elongating cells showed lamellar cortical ER and higher density of SYT1-GFP puncta, while in mature cells the cortical ER network was tubular, highly dynamic and had fewer SYT1-labeled puncta. The higher density of EPCS in young cells was verified by quantitative TEM of cryo-fixed tissues. For all cell types, the size of each EPCS had a consistent range in length along the PM from 50 to 300 nm, with microtubules and ribosomes excluded from the EPCS. The structural characterization of EPCS in different plant tissues, and the correlation of EPCS densities over developmental gradients illustrate how ER-PM communication evolves in response to cellular expansion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,677
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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