Proteomic approaches to early diagnosis of Johne’s disease in dairy cows
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) is the etiological agent of paratuberculosis or Johne’s disease (JD), an infectious, chronic granulomatous enteritis of ruminants. Current diagnostic tests for JD have limited sensitivity and specificity for the identification of subclinically infected animals warranting an investigation of MAP species-specific and sensitive antigens that might improve diagnostic test sensitivity and specificity. The aim of the first study was to identify antigenic proteins from the MAP cell envelope by comparing protein profiles from MAP, Mycobacterium avium subspecies hominissuis and M. smegmatis using a 2D-DIGE proteomic approach. Thirteen protein spots were selected and 15 proteins were subsequently identified by LC-MS/MS. The aim of the second study was to generate antibodies to recombinantly expressed MAP cell envelope proteins as well as to an extract of MAP total cell envelope proteins that was subsequently used to identify MAP organisms by IHC and immunomagnetic separation. Six MAP cell envelope proteins were recombinantly expressed, three of which were suitable for polyclonal antibody generation. Polyclonal antibodies generated to an extract of MAP cell envelope proteins detected MAP organisms in infected tissues using IHC and IF techniques thereby providing a more sensitive alternative to acid-fast staining of MAP in tissues for JD diagnosis. Furthermore, these antibodies were effective in immunomagnetic capture of MAP microorganisms in solution thereby providing proof-in-principle for a novel diagnostic approach. The objective of third study was to use an extract of MAP total cell envelope proteins as well as the six recombinant MAP proteins in ELISA formats to detect MAP-specific antibodies in cattle serum. The diagnostic sensitivity and specificity of the MAP envelope protein ELISA after serum absorption was 75% and 96% respectively. While ELISAs using the six recombinant protein antigens had reasonably high sensitivities, specificities were comparatively less than the commercial serum ELISA kit. The potential use of these recombinant proteins ELISAs for diagnosis of early MAP infection and control of JD requires further investigation and validation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».