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Enregistrement W2578369235 · doi:10.1021/acs.jproteome.6b00651

Characterization of the Molecular Mechanisms Underlying the Chronic Phase of Stroke in a Cynomolgus Monkey Model of Induced Cerebral Ischemia

2017· article· en· W2578369235 sur OpenAlexaff
Henry C.-H. Law, Samuel S.W. Szeto, Quan Quan, Yun Zhao, Zaijun Zhang, Olga Krakovska, Leong Ting Lui, Chengyou Zheng, Simon Ming‐Yuen Lee, K. W. Michael Siu, Yuqiang Wang, Ivan K. Chu

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of WindsorYork University
Organismes subventionnairesUniversity of Hong KongResearch Grants Council, University Grants CommitteeMinistry of Education of the People's Republic of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésNeurogenesisSynaptogenesisNeuroscienceStroke (engine)InflammationProteomicsIschemiaBrain ischemiaBioinformaticsBiologyPsychologyMedicineInternal medicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stroke is one of the main causes of mortality and long-term disability worldwide. The pathophysiological mechanisms underlying this disease are not well understood, particularly in the chronic phase after the initial ischemic episode. In this study, a Macaca fascicularis stroke model consisting of two sample groups, as determined by MRI-quantified infarct volumes as a measure of the stroke severity 28 days after the ischemic episode, was evaluated using qualitative and quantitative proteomics analyses. By using multiple online multidimensional liquid chromatography platforms, 8790 nonredundant proteins were identified that condensed to 5223 protein groups at 1% global false discovery rate (FDR). After the application of a conservative criterion (5% local FDR), 4906 protein groups were identified from the analysis of cerebral cortex. Of the 2068 quantified proteins, differential proteomic analyses revealed that 31 and 23 were dysregulated in the elevated- and low-infarct-volume groups, respectively. Neurogenesis, synaptogenesis, and inflammation featured prominently as the cellular processes associated with these dysregulated proteins. Protein interaction network analysis revealed that the dysregulated proteins for inflammation and neurogenesis were highly connected, suggesting potential cross-talk between these processes in modulating the cytoskeletal structure and dynamics in the chronic phase poststroke. Elucidating the long-term consequences of brain tissue injuries from a cellular prospective, as well as the molecular mechanisms that are involved, would provide a basis for the development of new potentially neurorestorative therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,289

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,252
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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