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Enregistrement W2578408762 · doi:10.1139/cjfas-2016-0379

Population biology of infectious diseases shared by wild and farmed fish

2017· article· en· W2578408762 sur OpenAlexafffundvenue
Martin Krkošek

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyAquacultureDomesticationBroodstockEpizooticPredationEcologyPopulationPathogenMetapopulationZoologyFisheryFish <Actinopterygii>OutbreakBiological dispersalGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Global fisheries landings ceased increasing decades ago, causing an increasing shortfall in wild seafood supply and an expansion of aquaculture. The abundance of domesticated fishes now dwarfs related wild fishes in some coastal seas, changing the dynamics of their infectious diseases. Transport and trade of seafood, feed, eggs, and broodstock bring pathogens into new regions and into contact with naïve hosts. Density-dependent transmission creates threshold effects where disease can abruptly switch from endemic to epizootic dynamics. Hydrodynamics allow pathogens to disperse broadly, interconnecting farms into metapopulations of domesticated host fish in regions that also support related species of wild fish. Spillover and spillback dynamics of pathogen transmission between wild and farmed fish can create novel transmission pathways or bioamplify pathogen abundance, potentially depressing or endangering wild fish. Mortality from natural predator–prey interactions may be synergistic or compensatory with these increased infections. Domestic environments may favour the evolution of undesirable pathogen traits, such as virulence and drug resistance, leading to the emergence of strains that cause high mortality and (or) evade treatment. Overall, these changes to the dynamics of infectious disease in coastal seas impose new constraints on the sustainability of both wild and farmed fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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