The MSS of complex networks with centrality based preference and its application to biomolecular networks
Notice bibliographique
Résumé
Networks are employed to represent many real world complex systems. For biological systems, biomolecules interact with each other to form so-called biomolecular networks. The explorations on the connections between structural control theory and biological networks have uncovered some interesting biological phenomena. Recently, some studies have paid attentions to the structural controllability of networks in notion of the minimum steering sets (MSSs). However, the MSSs for a complex network are not unique. Therefore, it is meaningful to find out the most special one with some centrality-based preference. The MSS of a network which has the maximum (minimum) average value of a certain centrality among all possible MSSs of the network can be identified by our method. Then we apply the method to the human liver metabolic network and find that centralities of steering nodes in different MSSs can be remarkably different. In addition, we observe that, for some centralities, the liver cancer reactions are significantly enriched in the MSSs with the minimum average centrality value. This result suggests that when investigating the controllability of biomolecular networks, the centralities, which could provide more meaningful biological information, can be taken into consideration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».