Norovirus Stool Loads in Cancer Patients With Norovirus Gastroenteritis
Notice bibliographique
Résumé
Background. Norovirus (NoV) infections are associated with substantial morbidity in immunocompromised patients. The relationship between stool norovirus viral loads (VLs) on immediate and long-term complications of NoV gastroenteritis in cancer patients has not been previously examined. We developed a real-time quantitative polymerase chain reaction (NoV-qPCR) assay to determine NoV genogroup GI and GII VL in stool. The VL at the time of diagnosis was determined and correlated with clinical characteristics as well as outcomes associated with NoV gastroenteritis patients with cancer. Methods. From March 2014 until January 2016, NoV PCR-positive stool specimens as determined by the Luminex xTAG Gastrointestinal Pathogen Panel (GPP) were included and subsequently tested by the NoV-qPCR assay. Each specimen was tested in duplicate, and geometric mean copies per gram of stool (GMC) were calculated. Electronic medical records were reviewed to extract relevant information on clinical severity of NoV infections based on modified Vesikari scores (MVS). Results. During the 23-month study period, 6918 stool specimens were submitted for testing by GPP. A total of 234 specimens (3.4%) from 154 patients were positive for NoV (GI, 33; GII, 201). The NoV-GII GMC ± standard deviation was 5.35 ± 1.59, which was significantly higher than that of NV-GI (3.94 ± 1.57, odds ratio [OR] = 7.87, p = 0.001). Based on the MVS criteria, 210 episodes were divided into mild (n = 122, GMC = 4.28 ± 1.49), moderate (n = 33, GMC = 5.55 ± 1.32), and severe (n = 55, GMC = 6.66 ± 0.86) clinical severity groups, respectively. In univariate analysis, higher stool NoVs were associated with GII infections, longer diarrhea duration, and more diarrhea frequency, longer vomiting duration, and more vomiting frequency, higher fever, as well as more total parenteral nutrition and deeper dehydration. In multivariate analysis, higher stool NoV VL at the time of diagnosis correlated with GII infections (OR = 3.25, 95% confidence interval [CI] = 1.18–8.97, P = 0.023) and predicted clinical severity (OR = 6.56, 95% CI = 2.35–18.36, P = 0.001). Conclusion. Norovirus GII infections are associated with a higher VL compared with GI. Regardless of infecting NoV genogroup, higher VL at diagnosis is associated with severe clinical disease and poor outcome. This quantification method may have utility for clinical monitoring. Disclosures. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».