Trophic Interactions of Infant Bifidobacteria and Eubacterium hallii during L-Fucose and Fucosyllactose Degradation
Notice bibliographique
Résumé
Fucosyllactoses (2’- or 3’-FL) account for up to 20% of human milk oligosaccharides (HMOs). Infant bifidobacteria, such as Bifidobacterium longum subsp. infantis, utilize the lactose moiety to form lactate and acetate, and metabolize L-fucose to 1,2-propanediol (1,2-PD). Eubacterium hallii is a common member of the adult gut microbiota that can produce butyrate from lactate and acetate, and convert 1,2-PD to propionate. Recently, a Swiss cohort study identified E. hallii as one of the first butyrate producers in the infant gut. However, the global prevalence of E. hallii and its role in utilization of HMO degradation intermediates remains unexplored. Fecal 16S rRNA gene libraries (n=857) of humans of all age groups from Venezuela, Malawi, Switzerland and the USA were screened for the occurrence of E. hallii. Single and co-culture experiments of B. longum subsp. infantis and E. hallii were conducted in modified YCFA containing acetate and glucose, L-fucose or FL. Bifidobacterium spp. (n=56) of different origin were screened for the ability to metabolize L-fucose. Relative abundance of E. hallii was low (10-5-10-3 %) during the first months but increased and reached adult levels (0.01-10%) at 5-10 years of age in all four populations. In single culture, B. longum subsp. infantis grew in the presence of all three carbohydrates while E. hallii was metabolically active only with glucose. In co-culture E. hallii also grew with L-fucose or FL. In co-cultures grown with glucose, acetate and glucose were consumed and nearly equimolar proportions of formate and butyrate were formed. B. longum subsp. infantis used L-fucose and produced 1,2-PD, acetate and formate in a ratio of 1:1:1, while 1,2-PD was used by E. hallii to form propionate. E. hallii consumed acetate, lactate and 1,2-PD released by B. longum subsp. infantis from FL, and produced butyrate, propionate, and formate. Beside B. longum subsp. infantis, Bifidobacterium breve and a strain of Bifidobacterium longum subsp. suis were able to utilize L-fucose. This study identified a trophic interaction of infant bifidobacteria and E. hallii during L-fucose degradation, and pointed at E. hallii as a metabolically versatile species that occurs in infants and utilizes intermediates of bifidobacterial HMO fermentation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».