Effects of several in-feed antibiotic combinations on the abundance and diversity of fecal microbes in weaned pigs
Notice bibliographique
Résumé
To characterize the effects of several subtherapeutic antibiotic combinations on the abundance and diversity of fecal microbes, 400 weaned pigs were selected and randomly assigned to 8 groups, where they were continuously fed different antibiotic combinations for 28 days. Then, a total of 48 pigs were randomly selected to collect feces samples for DNA extraction and 16S rRNA high-throughput sequencing. Compared with that of pigs without antibiotic administration, the diversities of fecal microbes were decreased in the pigs fed chlortetracycline (CTC), olaquindox (OLA), and either enramycin (ER) or virginiamycin (VIR), and the relative abundances of members of the phylum Bacteroidetes and the genus Prevotella were increased. Compared with that of pigs without antibiotic administration, the relative abundances of members of the phylum Proteobacteria and the genus Succinivibrio were decreased in the pigs fed CTC, a mixture of zinc bacitracin (ZB) + colistin sulfate (COL), a mixture of CTC+ZB+COL, a mixture of CTC+OLA, or a mixture of CTC+OLA+ER. α-Diversity and β-diversity were decreased (P < 0.05) in the pigs fed ZB+COL or a mixture of CTC+OLA+ER or CTC+OLA+VIR. This study provides experimental data to deepen our understanding on the effects of antibiotic combinations on intestinal microbes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».