Temperature-dependent metabolite production by Arctic actinomycetes
Notice bibliographique
Résumé
Actinomycetes are a well-established source of natural products with therapeutic potential, particularly for the treatment of infectious diseases. The exploration of microbes from underexplored habitats and the application of novel cultivation conditions are proven strategies for the discovery of novel bioactive metabolites. We set out to explore the metabolic diversity of cold-adapted actinomycetes isolated from marine sediments collected from Canada's Arctic. To screen for metabolites differentially regulated by temperature, 45 strains were fermented at 15 °C and 30 °C and the resulting chemical extracts were tested for antimicrobial activity. Seventy-six percent of the strains exhibited antimicrobial activity against one or more pathogens. Strikingly, extracts prepared from fermentations incubated at 15 °C generated double the number of hits than fermentations conducted at 30 °C. Overall, the majority (44%) of strains exhibited a greater frequency of antimicrobial activity when fermented at 15 °C. Metabolomic analysis (LC-HRMS) was utilized to assess the differential production of metabolites in response to temperature. The results of these experiments will be presented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».