Investigating coxiella burnetii at the livestock - wildlife interface
Notice bibliographique
Résumé
The intent of this project was to better understand the role of wildlife in the epidemiology of the zoonotic bacterium, Coxiella burnetii, at the livestock-wildlife interface. In Chapter 1, I compared the prevalence of C. burnetii DNA in dairy goats, other domestic animals, and wildlife on goat farms and adjacent natural areas. In Chapter 2, I compared the prevalence of C. burnetii DNA in different sample types from goats and wildlife, and assessed the level of agreement among the different samples. From April to August 2014, genital, fecal and milk samples were collected from goats on 16 Ontario dairy goat farms. Fecal and genital samples were also collected from other resident animals (cats, chickens, cows, dogs, horses, pigs), and from wildlife (deer mice, house mice, opossums, raccoons, red-backed voles, red squirrels and skunks) live-trapped on farms and from 14 adjacent natural areas. Coxiella burnetii was detected by PCR in samples from 89.2% (404/453) of goats, 68.8% (33/48) of other farm animals, 64.7% (44/68) of wild animals sampled on farms, and 58.1% (165/284) of wild animals sampled in natural areas. Coxiella burnetii was detected at all study sites and the prevalence in wildlife was similar on farms and adjacent natural areas, independent of site distances. These findings provide evidence to support the hypothesis that wildlife are able to maintain C. burnetii independent of livestock and may act as possible maintenance or reservoir hosts of C. burnetii at the livestock-wildlife interface. I determined that genital and fecal swab samples, which yielded the highest proportion positives, were optimal sample types to use for the detection of C. burnetii DNA in deer mice, eastern chipmunks, and raccoons. Genital swab, fecal swab and fecal material sample types were all suitable for detecting C. burnetii DNA in house mice and red squirrels. On the other hand, genital swab samples were optimal for detecting C. burnetii DNA in dairy goats and were significantly more likely to be positive for C. burnetii DNA than the other sample types. Additional studies need to be conducted to further elucidate the epidemiology of C. burnetii at the livestock-wildlife interface in southern Ontario and to confirm the optimal sample types to use for C. burnetii detection in wildlife and dairy goats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».