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Enregistrement W2581123218 · doi:10.1016/j.meegid.2017.01.027

Antigenic and genetic characterization of influenza viruses circulating in Bulgaria during the 2015/2016 season

2017· article· en· W2581123218 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueInfection Genetics and Evolution · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Health, British ColumbiaWellcome TrustFrancis Crick InstituteCancer Research UKMedical Research CouncilWellcome
Mots-clésSubcladeNeuraminidaseBiologyVirologyVirusLineage (genetic)Hemagglutinin (influenza)AntigenAntigenic variationH5N1 genetic structureAntigenic driftAntigenic shiftGeneGeneticsPhylogeneticsCladeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Influenza virological surveillance is an essential tool for early detection of novel genetic variants of epidemiologic and clinical significance. The aim of this study was to determine the antigenic and molecular characteristics of influenza viruses circulating in Bulgaria during the 2015/2016 season. The season was characterized by dominant circulation of A(H1N1)pdm09 viruses, accounting for 66% of detected influenza viruses, followed by B/Victoria-lineage viruses (24%) and A(H3N2) viruses (10%). All sequenced influenza A(H1N1)pdm09, A(H3N2) and B/Victoria-lineage viruses belonged to the 6B.1, 3C.2a and 1A genetic groups, respectively. Amino acid analysis of 57 A(H1N1)pdm09 isolates revealed the presence of 16 changes in hemagglutinin (HA) compared to the vaccine virus, five of which occurred in four antigenic sites, together with 16 changes in neuraminidase (NA) and a number of substitutions in proteins MP, NP, NS and PB2. Despite the many amino acid substitutions, A(H1N1)pdm09 viruses remained antigenically closely related to A/California/7/2009 vaccine virus. Bulgarian A(H3N2) strains (subclade 3C.2a) showed changes at 11 HA positions four of which were located in antigenic sites A and B, together with 6 positions in NA, compared to the subclade 3C.3a vaccine virus. They contained unique HA1 substitutions N171K, S312R and HA2 substitutions I77V and G155E compared to Bulgarian 3C.2a viruses of the previous season. All 20 B/Victoria-lineage viruses sequenced harboured two substitutions in the antigenic 120-loop region of HA, and 5 changes in NA, compared to the B/Brisbane/60/2008 vaccine virus. The results of this study reaffirm the continuous genetic variability of circulating seasonal influenza viruses and the need for continued systematic antigenic and molecular surveillance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,278
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle