Widespread Genetic Incompatibilities between First-Step Mutations during Parallel Adaptation of Saccharomyces cerevisiae to a Common Environment
Notice bibliographique
Résumé
Independently evolving populations may adapt to similar selection pressures via different genetic changes. The interactions between such changes, such as in a hybrid individual, can inform us about what course adaptation may follow and allow us to determine whether gene flow would be facilitated or hampered following secondary contact. We used Saccharomyces cerevisiae to measure the genetic interactions between first-step mutations that independently evolved in the same biosynthetic pathway following exposure to the fungicide nystatin. We found that genetic interactions are prevalent and predominantly negative, with the majority of mutations causing lower growth when combined in a double mutant than when alone as a single mutant (sign epistasis). The prevalence of sign epistasis is surprising given the small number of mutations tested and runs counter to expectations for mutations arising in a single biosynthetic pathway in the face of a simple selective pressure. Furthermore, in one third of pairwise interactions, the double mutant grew less well than either single mutant (reciprocal sign epistasis). The observation of reciprocal sign epistasis among these first adaptive mutations arising in the same genetic background indicates that partial postzygotic reproductive isolation could evolve rapidly between populations under similar selective pressures, even with only a single genetic change in each. The nature of the epistatic relationships was sensitive, however, to the level of drug stress in the assay conditions, as many double mutants became fitter than the single mutants at higher concentrations of nystatin. We discuss the implications of these results both for our understanding of epistatic interactions among beneficial mutations in the same biochemical pathway and for speciation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».