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A Recurrent De Novo Variant in NACC1 Causes a Syndrome Characterized by Infantile Epilepsy, Cataracts, and Profound Developmental Delay
Kelly Schoch, Linyan Meng, Szabolcs Szelinger, David Bearden, Asbjørg Stray‐Pedersen, Øyvind L. Busk, Nicholas Stong, Eriskay Liston, Ronald D. Cohn, Fernando Scaglia, Jill A. Rosenfeld, Jennifer Tarpinian, Cara Skraban, Matthew A. Deardorff, Jeremy Friedman, Zeynep Coban‐Akdemir, Mohamad A. Mikati, Peter G. Kranz, Joan Jasien, Allyn McConkie‐Rosell, Marie McDonald, Stephanie Burns Wechsler, Michael Freemark, Sujay Kansagra, Sharon F. Freedman, Deeksha Bali, Francisca Millan, Sherri J. Bale, Stanley F. Nelson, Hane Lee, Naghmeh Dorrani, David B. Goldstein, Rui Xiao, Yaping Yang, Jennifer E. Posey, Julián A. Martínez-Agosto, James R. Lupski, Michael F. Wangler, Vandana Shashi, Wayne W. Grody, Samuel P. Strom, Éric Vilain, Joshua L. Deignan, Fabiola Quintero‐Rivera, Sibel Kantarci, Sureni V. Mullegama, Sung‐Hae Kang, Mercedes E. Alejandro, Carlos A. Bacino, Ashok Balasubramanyam, Lindsay C. Burrage, Gary Clark, William J. Craigen, Shweta U. Dhar, Lisa Emrick, Brett H. Graham, Neil A. Hanchard, Mahim Jain, Seema R. Lalani, Brendan Lee, Richard A. Lewis, Azamian S. Mashid, Paolo Moretti, Sarah K. Nicholas, Jordan S. Orange, Lorraine Potocki, Daryl A. Scott, Alyssa A. Tran, Hugo J. Bellen, Shinya Yamamoto, Christine M. Eng, Donna M. Muzny, Patricia A. Ward, Andrea Gropman, Yong‐hui Jiang, Loren D.M. Peña, Rebecca C. Spillmann, Jennifer A. Sullivan, Alan H. Beggs, Lauren C. Briere, Cynthia M. Cooper, Laurel A. Donnell‐Fink, Elizabeth L. Krieg, Joel B. Krier, Sharyn A. Lincoln, Joseph Loscalzo, Richard L. Maas, Calum A. MacRae, J. Carl Pallais, Lance H. Rodan, Edwin K. Silverman, Joan M. Stoler, David A. Sweetser, Chris A. Walsh, Cecilia Esteves, Ingrid A. Holm, Isaac S. Kohane, Paul Mazur, Alexa T. McCray, Matthew Might, Rachel Ramoni, Kimberly Splinter, David Bick, Camille L. Birch, Braden Boone, Donna M. Brown, Dan C. Dorset, Lori H. Handley, Howard J. Jacob, Angela Jones, Jozef Lazar, Shawn Levy, J. Scott Newberry, Molly C. Schroeder, Kimberly A. Strong, Elizabeth A. Worthey, Jyoti G. Dayal, David J. Eckstein, Sarah E. Gould, Ellen M. Howerton, Donna M. Krasnewich, Carson R. Loomis, Laura A. Mamounas, Teri A. Manolio, John J. Mulvihill, Anastasia L. Wise, Ariane Soldatos, Matthew Brush, Jean-Philippe F. Gourdine, Melissa Haendel, David M. Koeller, Jennifer Kyle, Thomas Metz, Katrina M. Waters, Bobbie‐Jo Webb‐Robertson, Euan A. Ashley, Jonathan A. Bernstein, Annika M. Dries, Paul G. Fisher, Jennefer N. Kohler, Daryl Waggott, Matthew T. Wheeler, Patricia A. Zornio, Patrick Allard, Hayk Barseghyan, Esteban C. Dell’Angelica, Katrina M. Dipple, Matthew Herzog, Stan F. Nelson, Christina G.S. Palmer, Jeanette C. Papp, Janet S. Sinsheimer, Elizabeth A. Burke, Katherine R. Chao, Mariska Davids, David D. Draper, Tyra Estwick, Trevor S. Frisby, Kate Frost, Valerie Gartner, Rena A. Godfrey, Mitchell Goheen, Gretchen Golas, Mary “Gracie” G. Gordon, Catherine Groden, Mary E. Hackbarth, Isabel Hardee, Jean M. Johnston, Alanna E. Koehler, Lea Latham, Yvonne L. Latour, C. Christopher Lau, Denise J. Levy, Adam P. Liebendorder, Ellen F. Macnamara, Valerie V. Maduro, Thomas C. Markello, Alexandra J. McCarty, Jennifer L. Murphy, Michele Nehrebecky, Donna Novacic, Barbara N. Pusey, Sarah Sadozai, Katherine E. Schaffer, Prashant Sharma, Sara Thomas, Nathanial J. Tolman, Camilo Toro, Zaheer M. Valivullah, Colleen E. Wahl, Mike Warburton, Alec A. Weech, Guoyun Yu, David R. Adams, William A. Gahl, May Christine V. Malicdan, Cynthia J. Tifft, Lynne A. Wolfe, Paul R. Lee, John H. Postlethwait, Monte Westerfield, Anna Bican, Rizwan Hamid, John H. Newman, Amy K. Robertson, Joy D. Cogan
Notice bibliographique
RevueThe American Journal of Human Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteRegeneron PharmaceuticalsMarch of Dimes Foundation
Mots-clésMissense mutationMicrocephalyGeneticsBiologyNeurodevelopmental disorderIntellectual disabilityExome sequencingPhenotypeEpilepsyGermlineGlobal developmental delayAlleleGeneNeuroscience
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations51
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentnon