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Enregistrement W2582413206

Evolutionary significance of genomic and morphological variation in Icelandic Arctic charr (Salvelinus alpinus)

2011· dissertation· en· W2582413206 sur OpenAlexaboutno aff
Eva Küttner

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2011
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalvelinusIcelandicArcticVariation (astronomy)BiologyFisheryEvolutionary biologyZoologyArctic charGeographyEcologyFish <Actinopterygii>Trout
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

I examined the genetic architecture and evolutionary significance of the considerable morphological and life history variation in Arctic charr (Salvelinus alpinus) from natural and cultured populations in Iceland. I found that the sex determining locus in Icelandic Arctic charr is located on a different linkage group relative to the majority of the Atlantic lineage Arctic charr, including populations from the Fraser River in Labrador Canada and Swedish and Norwegian strains. In addition, there may be a possible conservation of a sex linkage arrangement in Icelandic Arctic charr and Atlantic salmon. These observations suggest that the differentiation of the sex determination chromosome in salmonids is still in the early stages. I then tested hypotheses regarding the genetic architecture of wild and cultured populations of Icelandic Arctic charr identifying the number and effect size of quantitative trait loci (QTL) and their conservation within and across salmonid species. QTL with genome-wide significance for body size, condition factor and age of maturation in cultured fish from the Icelandic breeding program were detected on multiple linkage groups. Comparisons with a North American cultured strain of Arctic charr and North American populations of Atlantic salmon and rainbow trout revealed some conservation in QTL. Additionally, I compared the genetic architecture of fork lengths in juvenile wild and cultured populations and found moderate conservation of genomic regions among Icelandic populations. I compared linear measurements taken on the cleared and stained heads of benthic and limnetic morphs from two lake populations expressing varying degrees of divergence. I found high genetic variation for craniofacial morphology in all morphs with no significant difference of plasticity levels between them. However, stronger family effects and weaker morph effects in the less derived lake population suggest higher genetic variation for craniofacial traits compared to the more derived system. Overall QTL (suggestive and significant) number and effect size was similar but the morphs hypothesized to be more derived within each lake had about half the number of significant QTL (p&lt;0.01) compared to their sympatric counterpart, suggesting fixation of alleles through canalization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,512

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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