Clinical and Molecular Epidemiology of Histoplasma capsulatum in Quebec, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Background. Histoplasma capsulatum (HC) comprises 8 phylogenetically distinct clades as defined by multilocus sequence typing (MLST). Limited animal data suggest that virulence of North American and Latin American strains of HC may differ, hypothetically accounting for unique clinical features observed in cohorts from different locations. Differential clinical disease has never been studied in patients with genotype-defined histoplasmosis. Methods. We conducted a retrospective cohort study including all culture-proven histoplasmosis cases from 4 university-affiliated hospitals in Quebec (Canada), between 1988 and 2013. HC isolates were genotyped using MLST. Demographic and clinical data were independently collected by chart review. Results. A total of 63 patients were included in this preliminary analysis. The median age was 42 years (range 21–81 years), and a majority of patients were male (n = 49, 77.8%). Forty-six (73.0%) patients were immunocompromised as a result of HIV infection (n = 28), solid organ transplantation (n = 8), rheumatologic disease (n = 6) or others (n = 4). Disseminated progressive histoplasmosis (DPH) was observed in 39 (61.9%) patients, while 16 (25.4%) and 5 (7.9%) patients presented with acute and chronic pulmonary forms, respectively. HC isolates were identified as North American 2 (NAm2), Latin American A (LAmA) and other clades in 31 (49.2%), 26 (41.3%) and 6 (9.5%) patients, respectively. Ten patients were born in South America, while 12 had reportedly traveled to this area. Patients infected with LAmA were younger (mean 40.2 versus 49.4 year-old; p = 0.02) and were more likely to be infected with HIV (17/26 versus 6/31; p = 0.005). There was a tendency towards an association between DPH and LAmA infection (p = 0.10). No significant differences were observed between NAm2 and LAmA infections with regards to clinical manifestations and outcomes (mortality, admission to intensive care unit and use of amphotericin B). Conclusion. We did not confirm distinct clinical features between NAm2 and LAmA histoplasmosis, although the study was underpowered to detect small differences. In our endemic region, a significant proportion of culture-proven histoplasmosis was not indigenous (travel- or immigration-associated). Disclosures. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».