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Enregistrement W2583034164

Characterization of FBXO9 in Drosophila melanogaster

2016· dissertation· en· W2583034164 sur OpenAlexfundno aff
Poly Talukdar

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2016
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMemorial University of Newfoundland
Mots-clésDrosophila melanogasterMelanogasterBiologySubstantia nigraUbiquitin ligaseNeuroscienceModel organismParkinson's diseaseMechanism (biology)DopaminergicUbiquitinCullinDiseaseCell biologyComputational biologyDopamineGeneticsMedicinePathology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of disease in model organisms is a fundamental and important stepping-stone in understanding and uncovering the mechanisms behind disease pathology in humans. The purpose of this work was to identify potential targets for the treatment and prevention of Parkinson disease using Drosophila melanogaster. Commonly known as the fruit fly, D. melanogaster is one of the important model organisms used extensively in biological research. Moreover, it has conserved developmental processes and mechanisms shared with human neurodegenerative disorders. Parkinson disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder characterized by death of dopamine producing cells of the substantia nigra affects about 1% of people over 60 years old worldwide. In mammals, Fbxo9 is a substrate recognition component of the SCF (SKP1-cullin-Fbox)-type E3 ubiquitin ligase complex. Some targets of Fbxo9, including an extensive array of proteins, are degraded via the ubiquitin-proteasome system. In this study, a potential D. melanogaster homologue of Fbxo9, CG5961, was identified. The Fbxo9 homologue in D. melanogaster has been conserved through evolution and retains many of the functional domains. The main goal of this project was to determine if Fbxo9 can be implicated in modeling PD in D. melanogaster. To investigate its role in neuronal survival, I over-expressed and down-regulated Fbxo9 in neuron-rich eye and dopaminergic neurons. Through assessments of eye morphology, climbing ability and ageing analysis, it was found that loss-of-function of Fbxo9 causes a PD like symptom. I expect that the knowledge obtained by determining the pathways involved in PD in D. melanogaster will help uncover potential new therapeutic approaches for research in human as well as other genes in both humans and flies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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