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Enregistrement W2583119958 · doi:10.1139/cjps-2016-0270

Identification of QTL underlying soybean agglutinin content in soybean seeds and analysis for epistatic effects among multiple genetic backgrounds and environments

2017· article· en· W2583119958 sur OpenAlexvenueno aff
Mingliang Yang, Junjie Ding, Haiyan Li, Meinan Sui, Jian Wang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuantitative trait locusEpistasisBiologyInteractionTraitGeneticsAgronomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soybean agglutinin (SBA), a major anti-nutritional factor in soybeans, seriously affects the safety of and effects on feed animals. Soybean varieties with lower SBA contents could play a positive role in the promotion of the fodder industry. In the present study, one male parent, Hefeng 45, was used in three recombinant I bred line (RIL) populations to detect quantitative trait loci (QTL) associated with SBA content across three different environments. As a result, a total of six, six, and four QTL related to SBA content were identified in the groups Hefeng 45 × Zhongdou 27 (HZ), Hefeng 45 × Dongnong 48 (HD), and Hefeng 45 × Taipingchuan Blacksoy (HT), respectively. Most of the QTL underlying SBA explained less than 10% of the phenotypic variation, but some major QTL with higher additive effects have stable expressions across different environments and RIL populations. On the contrary, many QTL dependent on the environment or RIL populations showed mainly weak effects, and gene × environment interaction occurred in the opposite direction to additive effects and (or) epistasis effects. Two (SbaHZC1-1 and SbaHZD1b-1, linked to Satt139 and Satt189, respectively) and one (SbaHDD1a-1, linked to Satt402) QTL for SBA were identified in HZ and HD populations, respectively, across three environments. Those QTL (Satt139 and Satt189) might have potential in the application of marker-assisted selection for low agglutinin content soybean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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