Assessment of a prognostic model, PSA metrics and toxicities in metastatic castrate resistant prostate cancer using data from Project Data Sphere (PDS)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Prognostic models in metastatic castrate resistant prostate cancer (mCRPC) may have clinical utility. Using data from PDS, we aimed to 1) validate a contemporary prognostic model (Templeton et al., 2014) 2) evaluate prognostic impact of concomitant medications and PSA decrease 3) evaluate factors associated with docetaxel toxicity. METHODS: We accessed data on 2,449 mCRPC patients in PDS. The existing model was validated with a continuous risk score, time-dependent receiver operating characteristic (ROC) curves, and corresponding time-dependent Area under the Curve (tAUC). The prognostic effects of concomitant medications and PSA response were assessed by Cox proportional hazards models. One year tAUC was calculated for multivariable prognostic model optimized to our data. Conditional logistic regression models were used to assess associations with grade 3/4 adverse events (G3/4 AE) at baseline and after cycle 1 of treatment. RESULTS: Despite limitations of the PDS data set, the existing model was validated; one year AUC, was 0.68 (95% CI 95% CI, .66 to .71) to 0.78 (95%CI, .74 to .81) depending on the subset of datasets used. A new model was constructed with an AUC of .74 (.72 to .77). Concomitant medications low molecular weight heparin and warfarin were associated with poorer survival, Metformin and Cox2 inhibitors were associated with better outcome. PSA response was associated with survival, the effect of which was greatest early in follow-up. Age was associated with baseline risk of G3/4 AE. The odds of experiencing G3/4 AE later on in treatment were significantly greater for subjects who experienced a G3/4 AE in their first cycle (OR 3.53, 95% CI 2.53-4.91, p < .0001). CONCLUSION: Despite heterogeneous data collection protocols, PDS provides access to large datasets for novel outcomes analysis. In this paper, we demonstrate its utility for validating existing models and novel model generation including the utility of concomitant medications in outcome analyses, as well as the effect of PSA response on survival and toxicity prediction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,015 | 0,035 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».