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Enregistrement W2583432826 · doi:10.1172/jci89626

Mutations in sphingosine-1-phosphate lyase cause nephrosis with ichthyosis and adrenal insufficiency

2017· article· en· W2583432826 sur OpenAlexafffund
Svjetlana Lovric, Sara Gonçalves, Heon Yung Gee, Babak Oskouian, Honnappa Srinivas, Won‐Il Choi, Shirlee Shril, Shazia Ashraf, Weizhen Tan, Jia Rao, Merlin Airik, David Schapiro, Daniela A. Braun, Carolin E. Sadowski, Eugen Widmeier, Tilman Jobst‐Schwan, Johanna Magdalena Schmidt, Vladimir Girik, Guido Capitani, Jung H. Suh, Noëlle Lachaussée, Christelle Arrondel, Julie Patat, Olivier Gribouval, Mónica Furlano, Olivia Boyer, Alain Schmitt, Vincent Vuiblet, Seema Hashmi, Rainer Wilcken, François P. Bernier, A. Micheil Innes, Jillian S. Parboosingh, Ryan E. Lamont, Julian Midgley, Nicola Wright, Jacek Majewski, Martin Zenker, Franz Schaefer, Navina Kuß, Johann Greil, Thomas Giese, Klaus Schwarz, Vilain Catheline, Denny Schanze, Ingolf Franke, Yves Sznajer, Anne S. Truant, Brigitte Adams, Julie Désir, Ronald Biemann, York Pei, Elisabet Ars, Núria Lloberas, A. Madrid, Vikas R. Dharnidharka, Anne M. Connolly, Marcia Willing, Megan A. Cooper, Richard P. Lifton, Matias Simons, Howard Riezman, Corinne Antignac, Julie D. Saba, Friedhelm Hildebrandt

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesMcGill UniversityAlberta Health Services
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research InstituteNational Health and Medical Research CouncilAgence Nationale de la RechercheNational Center of Competence in Research Chemical BiologyNational Center for Advancing Translational SciencesNational Research Foundation of KoreaMedical Research CouncilDeutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina - Nationale Akademie der WissenschaftenYonsei UniversityYonsei University College of MedicineDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Research FoundationNational Institute of General Medical SciencesOntario Genomics InstituteAustralian National UniversityEuropean CommissionNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesASN Foundation for Kidney ResearchSystemsX.chInstitut des maladies génétiques ImagineSwim Across AmericaSociedad Española de NefrologíaNational Institutes of HealthYale UniversitySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungOntario GenomicsGenome CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésBiologyIchthyosisNephrotic syndromeSlit diaphragmMissense mutationMutationPhenotypeAdrenal insufficiencyEndocrinologyInternal medicineGeneticsMedicineGeneKidneyPodocyte

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Steroid-resistant nephrotic syndrome (SRNS) causes 15% of chronic kidney disease cases. A mutation in 1 of over 40 monogenic genes can be detected in approximately 30% of individuals with SRNS whose symptoms manifest before 25 years of age. However, in many patients, the genetic etiology remains unknown. Here, we have performed whole exome sequencing to identify recessive causes of SRNS. In 7 families with SRNS and facultative ichthyosis, adrenal insufficiency, immunodeficiency, and neurological defects, we identified 9 different recessive mutations in SGPL1, which encodes sphingosine-1-phosphate (S1P) lyase. All mutations resulted in reduced or absent SGPL1 protein and/or enzyme activity. Overexpression of cDNA representing SGPL1 mutations resulted in subcellular mislocalization of SGPL1. Furthermore, expression of WT human SGPL1 rescued growth of SGPL1-deficient dpl1Δ yeast strains, whereas expression of disease-associated variants did not. Immunofluorescence revealed SGPL1 expression in mouse podocytes and mesangial cells. Knockdown of Sgpl1 in rat mesangial cells inhibited cell migration, which was partially rescued by VPC23109, an S1P receptor antagonist. In Drosophila, Sply mutants, which lack SGPL1, displayed a phenotype reminiscent of nephrotic syndrome in nephrocytes. WT Sply, but not the disease-associated variants, rescued this phenotype. Together, these results indicate that SGPL1 mutations cause a syndromic form of SRNS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations208
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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