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Enregistrement W2584079664 · doi:10.1369/0022155417690336

Advantages and Limitations of Salmon-Gal/Tetrazolium Salt Histochemistry for the Detection of <i>LacZ</i> Reporter Gene Activity in Murine Epithelial Tissue

2017· article· en· W2584079664 sur OpenAlexaff
Claudia Merkwitz, Orest W. Blaschuk, Jana Barbro Winkler, Angela Schulz, Simone Prömel, Albert Ricken

Notice bibliographique

RevueJournal of Histochemistry & Cytochemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStainingMolecular biologyChemistryEscherichia coliReporter geneChromogeniclac operonGeneImmunohistochemistryBiologyBiochemistryGene expressionChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Escherichia coli LacZ gene is a widely used reporter for gene regulation studies in transgenic mice. It encodes bacterial β-galactosidase (Bact β-Gal), which causes insoluble precipitates when exposed to chromogenic homologues of galactose. We and others have recently reported that Bact β-Gal detection with Salmon-Gal (S-Gal) in combination with nitro blue tetrazolium chloride (NBT) is very sensitive and not prone to interference by acidic endogenous β-galactosidases. Unfortunately, as we show here, the method appears to be inadequate for evaluation of Bact β-Gal expression in keratinized epithelial appendages but not in other keratinized epithelia. NBT in the reaction mixture, just as other tetrazolium salts, inevitably causes unwanted staining artifacts in lingual filiform papillae, penile spines, and hair fibers by interacting with keratin sulfhydryl-rich regions. The methodological limitation can be overcome in part by pretreating the tissues before the S-Gal/NBT staining with an iodine-potassium iodide solution. Alternatively, the use of iodonitrotetrazolium chloride instead of NBT in the S-Gal reaction mixture provides enough color resolution to distinguish the specific Bact β-Gal staining in orange from the artifact staining in dark red. In summary, we provide evidence that S-Gal/NBT histochemistry has limitations, when staining keratinized epithelial appendages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,039

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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