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Enregistrement W2584616035 · doi:10.1139/cjps-2016-0363

Isolation and characterization of Aconitate hydratase 4 (Aco4) from soybean

2017· article· en· W2584616035 sur OpenAlexvenueno aff
Zachary Coleman, Jessica Boelter, Katherine Espinosa, A. Susana Goggi, Reid G. Palmer, Devinder Sandhu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAconitaseGeneBiologyGeneticsGlycinePhylogenetic treeBiochemistryAmino acidEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aconitase catalyzes the reversible isomerization of two tricarboxylic acids, citrate and isocitrate, during the Krebs cycle. Five aconitase genes, namely, Aco1, Aco2, Aco3, Aco4, and Aco5, have been identified in soybean. Previously, Aco4 was mapped on chromosome 11. The purpose of this investigation was to isolate and sequence the candidate gene for Aco4. We mapped the Aco4 gene to a 148 kb region on chromosome 11 that contained 19 predicted genes. One of these, Glyma.11G080600, codes for aconitate hydratase. Sequencing of two isozyme variants (A-line and B-line) for Glyma.11G080600 revealed three synonymous and two non-synonymous substitutions. Perhaps, the two non-synonymous substitutions resulted in a variable isozyme pattern between the variants. Glyma.11G080600 contains a catalytic domain and a swivel domain that are known to catalyze isomerization of citrate to isocitrate and swiveling conformational change in the enzyme mechanism, respectively. Conservation of both the domains implies the role of Glyma.11G080600 in the interconversion of citrate and isocitrate. Glyma.11G080600 is expressed in most tissues, with maximum expression in leaves. Phylogenetic analysis of 25 genes from different species displayed three major clusters. Glyma.11G080600 (Aco4) and Glyma.01G162800, which are conserved in Glycine max (L.) Merr. and Glycine soja Siebold. & Zucc., may have common ancestry before G. max and G. soja split.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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