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Enregistrement W2584800155 · doi:10.1038/ncomms14143

Evidence for ACTN3 as a genetic modifier of Duchenne muscular dystrophy

2017· article· en· W2584800155 sur OpenAlexaff
Marshall W. Hogarth, Peter J. Houweling, Kristen C. Thomas, Heather Gordish‐Dressman, Luca Bello, V. Vishwanathan, S. Chidambaranathan, W. Douglas Biggar, Laura McAdam, Jean K. Mah, M. Tulinius, Avital Cnaan, Lauren P. Morgenroth, Robert T. Leshner, Carolina Tesi Rocha, Mathula Thangarajh, Tina Duong, Andrew J. Kornberg, Monique M. Ryan, Yoram Nevo, Alberto Dubrovsky, Paula R. Clemens, Hoda Abdel‐Hamid, Anne M. Connolly, Alan Pestronk, Jean Teasley, Tulio E. Bertorini, Richard Webster, Hanna Kolski, Nancy L. Kuntz, Sherilyn W. Driscoll, John B. Bodensteiner, Jose Carlo, Ksenija Gorni, Timothy Lotze, Peter Karachunski, Erik Henricson, Richard T. Abresch, Craig M. McDonald, Elena Pegoraro, Eric P. Hoffman, Stewart I. Head, Kathryn N. North

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Physical Performance
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAlberta Children's HospitalHolland Bloorview Kids Rehabilitation Hospital
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research Council
Mots-clésDuchenne muscular dystrophyMuscle weaknessMedicineMuscular dystrophyWeaknessPhenotypeInternal medicineClinical trialSkeletal muscleMuscle disorderDystrophinEndocrinologyBioinformaticsBiologyGeneticsAnatomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Duchenne muscular dystrophy (DMD) is characterized by muscle degeneration and progressive weakness. There is considerable inter-patient variability in disease onset and progression, which can confound the results of clinical trials. Here we show that a common null polymorphism (R577X) in ACTN3 results in significantly reduced muscle strength and a longer 10 m walk test time in young, ambulant patients with DMD; both of which are primary outcome measures in clinical trials. We have developed a double knockout mouse model, which also shows reduced muscle strength, but is protected from stretch-induced eccentric damage with age. This suggests that α-actinin-3 deficiency reduces muscle performance at baseline, but ameliorates the progression of dystrophic pathology. Mechanistically, we show that α-actinin-3 deficiency triggers an increase in oxidative muscle metabolism through activation of calcineurin, which likely confers the protective effect. Our studies suggest that ACTN3 R577X genotype is a modifier of clinical phenotype in DMD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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