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Enregistrement W2584822140 · doi:10.1084/jem.20161525

<i>EXTL3</i> mutations cause skeletal dysplasia, immune deficiency, and developmental delay

2017· article· en· W2584822140 sur OpenAlexafffund
Stefano Volpi, Yasuhiro Yamazaki, Patrick M. Brauer, Ellen van Rooijen, Atsuko Hayashida, Anne Slavotinek, Hye Sun Kuehn, Maja Di Rocco, Carlo Rivolta, Ileana Bortolomai, Likun Du, Kerstin Felgentreff, Lisa Ott de Bruin, Kazutaka Hayashida, George Freedman, Genni Enza Marcovecchio, Kelly Capuder, Prisni Rath, Nicole Luche, Elliott J. Hagedorn, Antonella Buoncompagni, Béryl Royer‐Bertrand, Silvia Giliani, Pietro Luigi Poliani, Luisa Imberti, Kerry Dobbs, Fabienne E. Poulain, Alberto Martini, John Manis, Robert J. Linhardt, Marita Bosticardo, Sergio D. Rosenzweig, Hane Lee, Jennifer M. Puck, Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker, Leonard I. Zon, Pyong Woo Park, Andrea Superti‐Furga, Luigi D. Notarangelo

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMinistero della SaluteUniversité de LausanneNational Heart, Lung, and Blood InstituteKrembil FoundationSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésBiologyZebrafishMissense mutationProgenitor cellCancer researchFibroblast growth factorStem cellCell biologyMolecular biologyMutationImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We studied three patients with severe skeletal dysplasia, T cell immunodeficiency, and developmental delay. Whole-exome sequencing revealed homozygous missense mutations affecting exostosin-like 3 (EXTL3), a glycosyltransferase involved in heparan sulfate (HS) biosynthesis. Patient-derived fibroblasts showed abnormal HS composition and altered fibroblast growth factor 2 signaling, which was rescued by overexpression of wild-type EXTL3 cDNA. Interleukin-2–mediated STAT5 phosphorylation in patients’ lymphocytes was markedly reduced. Interbreeding of the extl3-mutant zebrafish (box) with Tg(rag2:green fluorescent protein) transgenic zebrafish revealed defective thymopoiesis, which was rescued by injection of wild-type human EXTL3 RNA. Targeted differentiation of patient-derived induced pluripotent stem cells showed a reduced expansion of lymphohematopoietic progenitor cells and defects of thymic epithelial progenitor cell differentiation. These data identify EXTL3 mutations as a novel cause of severe immune deficiency with skeletal dysplasia and developmental delay and underline a crucial role of HS in thymopoiesis and skeletal and brain development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,393

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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