miR-135a-5p-mediated downregulation of protein tyrosine phosphatase receptor delta is a candidate driver of HCV-associated hepatocarcinogenesis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIMS: HCV infection is a leading risk factor of hepatocellular carcinoma (HCC). However, even after viral clearance, HCC risk remains elevated. HCV perturbs host cell signalling to maintain infection, and derailed signalling circuitry is a key driver of carcinogenesis. Since protein phosphatases are regulators of signalling events, we aimed to identify phosphatases that respond to HCV infection with relevance for hepatocarcinogenesis. METHODS: We assessed mRNA and microRNA (miRNA) expression profiles in primary human hepatocytes, liver biopsies and resections of patients with HCC, and analysed microarray and RNA-seq data from paired liver biopsies of patients with HCC. We revealed changes in transcriptional networks through gene set enrichment analysis and correlated phosphatase expression levels to patient survival and tumour recurrence. RESULTS: We demonstrate that tumour suppressor protein tyrosine phosphatase receptor delta (PTPRD) is impaired by HCV infection in vivo and in HCC lesions of paired liver biopsies independent from tissue inflammation or fibrosis. In liver tissue adjacent to tumour, high PTPRD levels are associated with a dampened transcriptional activity of STAT3, an increase of patient survival from HCC and reduced tumour recurrence after surgical resection. We identified miR-135a-5p as a mechanistic regulator of hepatic PTPRD expression in patients with HCV. CONCLUSIONS: We previously demonstrated that STAT3 is required for HCV infection. We conclude that HCV promotes a STAT3 transcriptional programme in the liver of patients by suppressing its regulator PTPRD via upregulation of miR-135a-5p. Our results show the existence of a perturbed PTPRD-STAT3 axis potentially driving malignant progression of HCV-associated liver disease.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».