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Enregistrement W2585183403 · doi:10.1139/cjpp-2017-0014

Downregulation of cytochrome P450 2C8 by 3-methylcholanthrene in human hepatocellular carcinoma cell lines

2017· article· en· W2585183403 sur OpenAlexafffundvenue
Rucha Utgikar, David S. Riddick

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2017
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDownregulation and upregulationCytochrome P450Cell cultureMethylcholanthreneHepatocyteHepatocellular carcinomaCYP2C8BiologyMessenger RNAChemistryCancer researchCell biologyCarcinogenEndocrinologyMetabolismIn vitroBiochemistryGeneCYP2C9Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The marked induction of cytochromes P450 such as CYP1A1 caused by polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) like 3-methylcholanthrene (MC) is often accompanied by suppression of other hepatic P450s. The molecular mechanisms, functional consequences, and human relevance of P450 downregulation by PAHs are poorly understood. MC suppresses mRNA levels for CYP2C8, an important human P450, in cultured human hepatocytes. To avoid hepatocyte lot-to-lot variability, we assessed CYP2C8 regulation by MC in HepaRG cells, a terminally differentiated human hepatocellular carcinoma cell line that maintains high P450 expression. MC strongly induced CYP1A1 mRNA levels and markedly downregulated CYP2C8 mRNA levels in HepaRG cells. Although MC also suppressed CYP2C8 mRNA levels in the HepG2 human hepatocellular carcinoma cell line, basal CYP2C8 expression was extremely low. HepaRG cells appear to be an appropriate model system for studying the mechanisms and functional consequences of CYP2C8 downregulation by PAHs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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