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Enregistrement W2586248620 · doi:10.1182/blood.v128.22.3865.3865

Sphingolipids Regulate Myeloid-Erythroid Fate Determination in Human Hematopoiesis

2016· article· en· W2586248620 sur OpenAlexaff
Stephanie Z. Xie, Kerstin B. Kaufmann, Olga I. Gan, Sasan Zandi, Naoya Takayama, John E. Dick

Notice bibliographique

RevueBlood · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSphingolipid Metabolism and Signaling
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCell biologyMyeloidHaematopoiesisGATA1MyelopoiesisSphingolipidProgenitor cellLymphopoiesisPopulationStem cellCell fate determinationTranscription factorImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The established model of hematopoiesis posits mature blood lineages are derived through successive stages of progenitors that become increasingly lineage-restricted. Whereas the master transcriptional regulators of myeloid-erythroid fate specification such a in Pu.1, Gata1 and CEBPalpha are well studied, the signaling networks that link extrinsic niche signals to lineage commitment is ill-defined. Sphingosine-1-phosphate (S1P) is a bioactive lipid produced from sphingolipid metabolism that in mice has been implicated in HSC egress, lymphocyte trafficking and lymphocyte lineage determination, mainly through the receptor S1PR1. However, the role of sphingolipid biology in human lineage specification is unknown. Gene expression profiling of 11 highly resolved populations of human stem, progenitor and lineage commited cells was undertaken to gain insight into the transcriptional signatures that define each cell population and the changes that occur during lineage commitment. We previously established that sphingolipid metabolism is transcriptionally distinct between HSC and progenitors (Xie et al In prep). Unbiased clustering of RNA-seq data of 46 sphingolipid genes was sufficient to segregate mature human erythroid, lymphoid, and myeloid cells suggesting that tight regulation of S1P signaling is required for lineage commitment. Myeloid cells have the highest transcriptional expression of S1P receptors among mature lineages whereas erythroid cells have little to no expression predicting that S1P signaling may be important in governing myeloid-erythroid fate. We found that manipulating S1P transport via overexpression of the S1P transporter SPNS2 in cord blood was sufficient to limit erythropoiesis as assayed by single cell in vitro assays and in vivo xenotransplantation. S1P signals through a family of 5 G-protein coupled S1P receptors, with S1PR3 expression being myeloid-specific. S1PR3 protein expression is restricted in the primitive human hematopoietic hierarchy to only a subset of granulocyte-macrophage progenitors. Enforced expression of S1PR3 in HSC, MPP (multipotent progenitors) and CMP (common myeloid progenitors) is sufficient to inhibit erythropoiesis and upregulate myelopoiesis in single cell stromal-based assays suggesting S1PR3 has a unique role in myeloid-erythroid fate specification. Flow cytometry analysis shows S1PR3 protein is highly overexpressed in primary AML relative to normal blood cells, suggesting S1P biology is dysregulated in AML. Collectively, our studies provide the first direct evidence that the S1P pathway governs fate determination along myeloid-erythroid lineage commitment. Future studies will need to be undertaken to determine how this new mechanism of lineage commitment is linked to the transcription factor network. Our studies also suggest that this pathway may play a role in AML biology raising the possibility of a new therapeutic direction for AML. Disclosures No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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