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Enregistrement W2586281702 · doi:10.18383/j.tom.2016.00235

Radiomics of Lung Nodules: A Multi-Institutional Study of Robustness and Agreement of Quantitative Imaging Features

2016· article· en· W2586281702 sur OpenAlexaff
Jayashree Kalpathy–Cramer, Artem Mamomov, Binsheng Zhao, Lin Lü, Dmitry Cherezov, Sandy Napel, Sebastian Echegaray, Daniel L. Rubin, Michael F. McNitt‐Gray, Pechin Lo, Jessica C. Sieren, Johanna Uthoff, Samantha K. N. Dilger, Brandan Driscoll, Ivan Yeung, Lubomir M. Hadjiiski, Yoganand Balagurunathan, Robert J. Gillies, Dmitry B. Goldgof

Notice bibliographique

RevueTomography · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésPattern recognition (psychology)CorrelationConcordance correlation coefficientArtificial intelligenceFeature (linguistics)RadiomicsConcordanceSegmentationRobustness (evolution)Feature extractionComputer scienceMargin (machine learning)MathematicsStatisticsMedicineMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Radiomics is to provide quantitative descriptors of normal and abnormal tissues during classification and prediction tasks in radiology and oncology. Quantitative Imaging Network members are developing radiomic "feature" sets to characterize tumors, in general, the size, shape, texture, intensity, margin, and other aspects of the imaging features of nodules and lesions. Efforts are ongoing for developing an ontology to describe radiomic features for lung nodules, with the main classes consisting of size, local and global shape descriptors, margin, intensity, and texture-based features, which are based on wavelets, Laplacian of Gaussians, Law's features, gray-level co-occurrence matrices, and run-length features. The purpose of this study is to investigate the sensitivity of quantitative descriptors of pulmonary nodules to segmentations and to illustrate comparisons across different feature types and features computed by different implementations of feature extraction algorithms. We calculated the concordance correlation coefficients of the features as a measure of their stability with the underlying segmentation; 68% of the 830 features in this study had a concordance CC of ≥0.75. Pairwise correlation coefficients between pairs of features were used to uncover associations between features, particularly as measured by different participants. A graphical model approach was used to enumerate the number of uncorrelated feature groups at given thresholds of correlation. At a threshold of 0.75 and 0.95, there were 75 and 246 subgroups, respectively, providing a measure for the features' redundancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,029
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,095
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,151

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0290,095
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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