Patterns of Diversity and Spatial Variability of β-Defensin Innate Immune Genes in a Declining Wild Population of Tree Swallows
Notice bibliographique
Résumé
Assessing the genetic variation and distribution of immune genes across heterogeneous environmental conditions in wild species is essential to further our understanding of the role of pathogen pressure and potential resistance or prevalence in hosts. Researchers have recently investigated β-defensin genes in the wild, because their variability suggests that they may play an important role in innate host defense. This study investigated the variation occurring at 6 innate immune genes of the β-defensin family in a declining population of tree swallows (Tachycineta bicolor) in southern Québec, Canada (N = 160). We found that all 6 genes showed synonymous and nonsynonymous single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the exon coding for the mature peptide. These results indicated that this group of genes was diverse in tree swallows. Our results suggested a potential interaction of this group of genes with fluctuating pathogen diversity, however, we found no sign of positive or negative selection. We assessed whether or not the distribution of genetic diversity of β-defensin genes in our study population differed between 2 regions that strongly differ in their level of agricultural intensification. Adults are highly philopatric to their breeding sites and their immunological responses differ between these 2 regions. However, we found little evidence that the level and distribution of genetic variability differed between these heterogeneous environmental conditions. Further studies should aim to assess the link between genetic diversity of β-defensin genes and fitness-related traits in wild populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».