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Enregistrement W2586922652 · doi:10.1371/journal.pone.0171874

Characterization of Ghrelin O-Acyltransferase (GOAT) in goldfish (Carassius auratus)

2017· article· en· W2586922652 sur OpenAlexafffund
Ayelén Melisa Blanco, Miguel Gómez-Boronat, A.L. Alonso-Gómez, Roman Yufa, Suraj Unniappan, M.J. Delgado, Ana I. Valenciano

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanYork University
Organismes subventionnairesMinisterio de Economía y CompetitividadCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Health Research Foundation
Mots-clésGhrelinBiologyComplementary DNAMolecular biologyBiochemistryGeneHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ghrelin is the only known hormone posttranslationally modified with an acylation. This modification is crucial for most of ghrelin's physiological effects and is catalyzed by the polytopic enzyme ghrelin O-acyltransferase (GOAT). The aim of this study was to characterize GOAT in a teleost model, goldfish (Carassius auratus). First, the full-length cDNA sequence was obtained by RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends methods. Two highly homologous cDNAs of 1491 and 1413 bp, respectively, named goat-V1 and goat-V2 were identified. Deduced protein sequences (393 and 367 amino acids, respectively) are predicted to present 11 and 9 transmembrane regions, respectively, and both contain two conserved key residues proposed to be involved in catalysis: asparagine 273 and histidine 304. RT-qPCR revealed that both forms of goat mRNAs show a similar widespread tissue distribution, with the highest expression in the gastrointestinal tract and gonads and less but considerable expression in brain, pituitary, liver and adipose tissue. Immunostaining of intestinal sections showed the presence of GOAT immunoreactive cells in the intestinal mucosa, some of which colocalize with ghrelin. Using an in vitro approach, we observed that acylated ghrelin downregulates GOAT gene and protein levels in cultured intestine in a time-dependent manner. Finally, we found a rhythmic oscillation of goat mRNA expression in the hypothalamus, pituitary and intestinal bulb of goldfish fed at midday, but not at midnight. Together, these findings report novel data characterizing GOAT, and offer new information about the ghrelinergic system in fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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