MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2586953518 · doi:10.1182/blood.v118.21.2274.2274

Dysregulation of C10orf55 Expression in Megakaryocytic Cell Lineage From Quebec Platelet Disorder Individuals

2011· article· en· W2586953518 sur OpenAlexaffabout
Natalia Bunimov, Jessica Blavignac, Subia Tasneem, John S. Waye, Andrew D. Paterson, Georges E. Rivard, Catherine P.M. Hayward

Notice bibliographique

RevueBlood · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineHospital for Sick ChildrenMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPlateletPlatelet disorderGeneMolecular biologyImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 2274 Quebec platelet disorder (QPD) is a unique and serious bleeding disorder, associated with a gain-of-function defect in fibrinolysis that leads to a delayed onset bleeding after surgery or trauma in affected individuals. It has an autosomal dominant pattern of inheritance and affected individuals typically demonstrate an extensive personal and family history of bleeding. The disorder is caused by a tandem duplication mutation of a 78-kb genomic region located on chromosome 10 that contains PLAU (the gene that encodes urokinase plasminogen activator, uPA) in addition to the gene C10orf55, a gene of unknown function that encodes a transcript with partial complementary regions to PLAU mRNA. While QPD has minimal effects on uPA in urine, plasma and many other cell types, it elevates uPA levels >100 fold in QPD platelets compared to controls, due to overexpression of PLAU during megakaryopoiesis. As C10orf55 expression is postulated to have negative regulatory effects on uPA expression, we investigated if there is evidence of C10orf55 dysregulation in QPD. TaqMan assays were utilized for quantitative real-time RT-PCR analysis of C10orf55 transcripts in QPD and control CD34+ peripheral hematopoietic progenitors, platelets, lymphoblasts and saliva buccal cells (n=4–8 control and patient subjects for each cell type). QPD platelets contained elevated levels of C10orf55 mRNA that were >130 fold higher than in control platelets (p<0.001). Whereas in the other QPD cell types that were examined, the levels of C10orf55 mRNA were within the range expected for one additional copy of this gene, based on transcript levels measured in the control cells. These data demonstrate that the tandem duplication mutation of QPD leads to megakaryocyte specific increases in C10orf55 expression that parallel the pathological changes in PLAU expression during megakaryopoiesis. Although C10orf55 has been postulated to downregulate PLAU expression, due to complementarity of its transcripts, this seems unlikely given our findings. Our study indicates that the pathogenesis of QPD involves megakaryocyte-differentiation specific dysregulation of both genes contained in the 78-kb tandem duplicated locus on chromosome 10. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,813
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood→Même sujetPlatelet Disorders and Treatments→Travaux en français237 207→