Dysregulation of C10orf55 Expression in Megakaryocytic Cell Lineage From Quebec Platelet Disorder Individuals
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Abstract 2274 Quebec platelet disorder (QPD) is a unique and serious bleeding disorder, associated with a gain-of-function defect in fibrinolysis that leads to a delayed onset bleeding after surgery or trauma in affected individuals. It has an autosomal dominant pattern of inheritance and affected individuals typically demonstrate an extensive personal and family history of bleeding. The disorder is caused by a tandem duplication mutation of a 78-kb genomic region located on chromosome 10 that contains PLAU (the gene that encodes urokinase plasminogen activator, uPA) in addition to the gene C10orf55, a gene of unknown function that encodes a transcript with partial complementary regions to PLAU mRNA. While QPD has minimal effects on uPA in urine, plasma and many other cell types, it elevates uPA levels >100 fold in QPD platelets compared to controls, due to overexpression of PLAU during megakaryopoiesis. As C10orf55 expression is postulated to have negative regulatory effects on uPA expression, we investigated if there is evidence of C10orf55 dysregulation in QPD. TaqMan assays were utilized for quantitative real-time RT-PCR analysis of C10orf55 transcripts in QPD and control CD34+ peripheral hematopoietic progenitors, platelets, lymphoblasts and saliva buccal cells (n=4–8 control and patient subjects for each cell type). QPD platelets contained elevated levels of C10orf55 mRNA that were >130 fold higher than in control platelets (p<0.001). Whereas in the other QPD cell types that were examined, the levels of C10orf55 mRNA were within the range expected for one additional copy of this gene, based on transcript levels measured in the control cells. These data demonstrate that the tandem duplication mutation of QPD leads to megakaryocyte specific increases in C10orf55 expression that parallel the pathological changes in PLAU expression during megakaryopoiesis. Although C10orf55 has been postulated to downregulate PLAU expression, due to complementarity of its transcripts, this seems unlikely given our findings. Our study indicates that the pathogenesis of QPD involves megakaryocyte-differentiation specific dysregulation of both genes contained in the 78-kb tandem duplicated locus on chromosome 10. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».