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Enregistrement W2587227059 · doi:10.1093/neuonc/now212.844

TMIC-04. GLIOBLASTOMA-ASSOCIATED MYELOID CELLS DISPLAY NONPOLARIZED M0 MACROPHAGE PHENOTYPE

2016· article· en· W2587227059 sur OpenAlexaff
Konrad Gabrusiewicz, Blanca Rodríguez, Jun Wei, Yuuri Hashimoto, Luke M. Healy, Sourindra Maiti, Ginu Thomas, Shouhao Zhou, Qianghu Wang, Ahmed Elakkad, Brandon Liebelt, Nasser K. Yaghi, Ravesanker Ezhilarasan, Neal Huang, Jeffrey S. Weinberg, Sujit S. Prabhu, Ganesh Rao, Raymond Sawaya, Lauren A. Langford, Janet Bruner, Gregory Fuller, Amit Bar‐Or, Wei Li, Rivka R. Colen, Michael A. Curran, Krishna Bhat, Jack P. Antel, Laurence J.N. Cooper, Erik P. Sulman, Amy B. Heimberger

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueNanoparticle-Based Drug Delivery
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrogliaIntegrin alpha MImmune systemMyeloidFlow cytometryMyeloid-derived Suppressor CellCancer researchBiologyMacrophagePhenotypeTumor microenvironmentImmunologyPathologyInflammationMedicineCancerGeneSuppressorIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The glioblastoma (GBM) microenvironment is commonly infiltrated with innate immune cells including microglia, macrophages, and myeloid-derived suppressor cells (MDSCs). Presumably these cells assume a tumor-supportive alternatively activated M2 phenotype, but no comprehensive phenotypic and/or genotypic studies have been conducted yet. Flow cytometry analysis was utilized to determine the expression of M1 and M2 markers in the GBM-associated myeloid cells (GAMs). Whole-genome microarray analysis was performed using RNA isolated from GAMs and matched GBM-patient and healthy-donor blood myeloid cells. Nanostring Technology was used to profile immune system- and cancer-related genes in GAMs, matched GBM-patient blood myeloid cells, healthy-donor blood myeloid cells, normal human microglia, and nonpolarized M0 and M1-, M2a-, M2c-polarized macrophages. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) was used to identify hallmarks of biological states or processes in immune cells derived from GBM-patient blood and tissue compared to healthy donors. Among CD11b+ cells, microglia and MDSCs constituted a higher percentage of GAMs compared to macrophages. In contrast, microglia were the most common CD11b+cells isolated from nonmalignant surgical brain samples, with macrophages constituting the remaining contributor to the brain parenchyma. Classical GBMs had significantly higher number of MDSCs than macrophages, while the mesenchymal subtype had more microglia than MDSCs and macrophages. The number of GAMs positively corresponded with the overall tumor size (precisely with edema) but not with overall patient survival. Flow cytometry studies and gene expression profile analysis revealed that GAMs express both anti-tumor M1 and tumor-supportive M2 markers. GSEA identified biological processes in these cells relative to matched blood cells, including signaling by KRAS, TGF-β, and TNF-α, epithelial-mesenchymal transition, angiogenesis, and hypoxia. Unsupervised analysis of gene expression profiles showed that GAMs aligned closely with nonpolarized M0 macrophages. New immunotherapeutic strategies for GBM are needed to redirect nonpolarized M0 GAMs towards the M1 phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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