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Enregistrement W2587363976 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjx002.884

P763 Fucosyltransferase 2 non-secretor status in Crohn's disease: a prospective observational analysis

2017· article· en· W2587363976 sur OpenAlexaffabout
Robert Battat, Uri Kopylov, Waqqas Afif, Talat Bessissow, Joshua Byer, Serge Dionne, Elana Zelikovic, Ernest G. Seidman, Alain Bitton

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General HospitalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFucosyltransferaseSingle-nucleotide polymorphismCrohn's diseaseImmunologyNOD2FucosylationMedicineBiologyDiseaseInternal medicineGenotypeGeneGeneticsFucose

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The FUT2 gene encodes fucosyltransferase 2 (FUT2), regulating intestinal antigen secretion and bacterial adherence. FUT2 homozygous mutations (FUT2M) and subsequent non-secretor status is associated with Crohn's disease (CD). A nucleotide polymorphism encoding a nonsense variant may predispose to CD by disrupting bacterial adherence or mucin fucosylation. This alters bacterial and mucous protection against pathogens, causing immune disequilibrium and mucosal inflammation. FUT2 products also interact with the IL 12/23 inflammatory pathways. Supporting genome wide association studies strongly associate homozygous FUT2 SNPs in strong linkage disequilibrium (LD) (rs602662 (A), rs676388 (C), rs492602 (G), rs504963 (A), rs601338 (A), rs485186 (G)), non-secretion, and CD. rs601338 (W143X) is the common null allele in Caucasians associated with the ABO non-secretory phenotype. Methods: We conducted a cross-sectional observational study of consecutive adult CD outpatients at the McGill University Health Center (2013–2015). Clinical and biochemical data were prospectively collected at a single routine office visit. We analyzed associations between CD and FUT2 mutation status. Results: Sixty-two CD patients were recruited. FUT2M homozygotes (rs602662, rs601338 or any mutation in LD) were detected in 27% of CD (17/62). Compared to Wild type (n=18), CD FUT2M homozygotes (n=17) had less penetrating CD (18% vs. 56%, p=0.02) and higher clinical remission without biologic or immunomodulator therapy (47% vs 6%, p=0.006). The latter was not observed in heterozygotes (22%, n=27, p=0.15). CD FUT2M homozygotes had similar disease location in the ileum (L2 p=0.31) and colon (L1, L3, p=0.56). Similarly, patients with homozygous rs601338 (n=15) had increased clinical remission rates without biologic or immunomodulator therapy (53% vs 5%, p=0.0016) compared to patients with wild type status (n=19). This was not observed in heterozygotes (24%, n=25, p=0.09). Both rs601338 homozygotes (20%) and heterozygotes (24%) had less penetrating disease than Wild type (53%, p=0.0495, 0.0478). rs601338 homozygotes (67%) but not heterozygotes (56%) had more luminal phenotype compared to non-mutants (32%, p=0.042). Conclusions: FUT2 homozygous mutations in CD was associated with a milder disease course: lower rates of penetrating disease and higher rates of remission without need for biologic or immunomodulator therapy. FUT2 may play a role in the natural history of CD through mofification of expression of adherence molecules and gut dysbiosis. Further studies are needed to confirm these findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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