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Enregistrement W2587392482 · doi:10.1139/cjm-2016-0599

Physiological and molecular characterization of compost bacteria antagonistic to soil-borne plant pathogens

2017· article· en· W2587392482 sur OpenAlexaffvenue
Rowida Mohamed, Emma Groulx, Stefanie Defilippi, Tamara Erak, James T. Tambong, Russell J. Tweddell, Apollinaire Tsopmo, Tyler J. Avis

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversité LavalAgriculture and Agri-Food CanadaCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBacteriaVerticillium dahliaePaenibacillus polymyxaAntimicrobialMicrobiologyPaenibacillusBacillus (shape)ArthrobacterAlternariaPseudomonasBotany16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disease suppressive composts have the potential to mitigate the risks associated with chemical pesticides. One of the main characteristics responsible for the suppressive nature of composts is their microbiological populations. To gain insight into the determinants responsible for their suppressive effects, we assayed composts to (i) isolate and identify beneficial antagonistic bacteria, (ii) quantify their antifungal and anti-oomycetal activities, (iii) extract inhibitory compounds produced by the bacteria, and (iv) identify antimicrobial lipopeptides produced by these bacteria. The antagonistic bacteria belonged to the genera Arthrobacter, Pseudomonas, Bacillus, Brevibacillus, Paenibacillus, and Rummeliibacillus and had the ability to antagonise the growth of Fusarium sambucinum, Verticillium dahliae, and (or) Pythium sulcatum. These bacteria produced antimicrobial compounds that affected the mycelial growth and (or) conidial germination of the pathogens. Mass spectrometry analyses showed the presence of various antimicrobial lipopeptides in Bacillus and Bacillus-related spp. extracts, demonstrating that they are responsible, at least in part, for the antagonistic activity of the bacteria. Results from this work provide greater insight into some of the biological, biochemical, and physiological determinants of suppressiveness in composts involved in the control of plant pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,754
Score d'incertitude au seuil0,446

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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