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Enregistrement W2587895918 · doi:10.1038/s41523-016-0003-5

Molecular stratification of early breast cancer identifies drug targets to drive stratified medicine

2017· article· en· W2587895918 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

Revuenpj Breast Cancer · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCancer Research UKCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of OntarioOntario Institute for Cancer Research
Mots-clésOncologyMedicineBreast cancerInternal medicineGene signatureDruggabilityTamoxifenCohortHazard ratioCancerBioinformaticsGeneBiologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Many women with hormone receptor-positive early breast cancer can be managed effectively with endocrine therapies alone. However, additional systemic chemotherapy treatment is necessary for others. The clinical challenges in managing high-risk women are to identify existing and novel druggable targets, and to identify those who would benefit from these therapies. Therefore, we performed mRNA abundance analysis using the Tamoxifen and Exemestane Adjuvant Multinational (TEAM) trial pathology cohort to identify a signature of residual risk following endocrine therapy and pathways that are potentially druggable. A panel of genes compiled from academic and commercial multiparametric tests as well as genes of importance to breast cancer pathogenesis was used to profile 3825 patients. A signature of 95 genes, including nodal status, was validated to stratify endocrine-treated patients into high-risk and low-risk groups based on distant relapse-free survival (DRFS; Hazard Ratio = 5.05, 95% CI 3.53–7.22, p = 7.51 × 10 −19 ). This risk signature was also found to perform better than current multiparametric tests. When the 95-gene prognostic signature was applied to all patients in the validation cohort, including patients who received adjuvant chemotherapy, the signature remained prognostic (HR = 4.76, 95% CI 3.61-6.28, p = 2.53× 10 −28 ). Functional gene interaction analyses identified six significant modules representing pathways involved in cell cycle control, mitosis and receptor tyrosine signaling; containing a number of genes with existing targeted therapies for use in breast or other malignancies. Thus the identification of high-risk patients using this prognostic signature has the potential to also prioritize patients for treatment with these targeted therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,704
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle