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Enregistrement W2587923643 · doi:10.1093/neuonc/now212.484

MPTH-49. IS GANGLIOGLIOMA A CNS TUMOR WITH ARRESTED DEVELOPMENT?

2016· article· en· W2587923643 sur OpenAlexaffabout
David D. Eisenstat, Frank K.H. van Landeghem

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSynaptophysinBiologyNeuNGlial fibrillary acidic proteinNeuroepithelial cellNeurosphereOLIG2Cancer researchNeural stem cellProgenitor cellForebrainPathologyMolecular biologyImmunohistochemistryStem cellEmbryonic stem cellGeneticsCentral nervous systemMedicineOligodendrocyteNeuroscienceImmunologyGeneAdult stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gangliogliomas (GG) are low grade neuroepithelial tumours of the central nervous system (CNS) comprised of neoplastic glial and neuronal cells. There are no animal models or cell lines to study. Microarray data of a panel of low grade gliomas including GG revealed overexpression of the DLX2 homeobox gene required for tangential interneuronal migration and differentiation in the embryonic forebrain. We hypothesized that DLX2 regulates neural versus glial cell fate decisions in CNS progenitors and that GG are arrested in development. DLX2 expression was examined along with glial fibrillary acidic protein (GFAP; glial marker) and synaptophysin and/or NeuN (neuronal markers) expression in a cohort of GG tumours using immunohistochemistry and dual immunofluorescence labelling of formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue sections. BRAF mutational status was also assessed. In our discovery cohort (Genoa), 10/30 samples (33%) expressed DLX2. In our validation cohort (Edmonton), 22/36 (61%) expressed nuclear DLX2 and 12/22 DLX2+ cases had BRAF mutations (55%; 11 V600E, 1 V600G). 12/18 cases with BRAF mutations were DLX2+ (67%). One heavily pre-treated child with progressive cervicomedullary GG has had a very good partial response to BRAF inhibitor therapy. All 22 DLX2+ tumours co-expressed GFAP (100%) and 21/22 (95%) also expressed synaptophysin or NeuN. Our results support GG as neurodevelopmental tumours arising from bipotential CNS progenitors that are arrested at the neural-glial cell fate “decision” point. Biological or differentiation-based treatments could be considered +/- BRAF inhibitors for those GG with/without the V600E mutation, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
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