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Enregistrement W2587925277 · doi:10.1200/jco.2011.29.4_suppl.45

Establishment of primary human esophageal xenografts: Rationale for selection and cancer model.

2011· article· en· W2587925277 sur OpenAlexaff
Lorin Dodbiba, Jennifer Teichman, Aliya Ramjaun, M. Li, Benlu Sun, Z. Chen, D. J. Renouf, Ming‐Sound Tsao, Laurie Ailles, G. Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineEsophageal cancerEsophagusCancerTransplantationPathologyAdenosquamous carcinomaPrimary tumorOncologyInternal medicineCancer researchAdenocarcinomaMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

45 Background: New animal models of esophageal cancer are required to accelerate research into novel treatment strategies. Mouse xenografts used in pre-clinical drug testing are typically derived from cell lines, but several esophageal cancer cell lines have been contaminated (PMID 20075370). Xenografts implanted from surgically resected human tumors are a potentially viable model, and may better recapitulate the characteristics of the original tumor. We describe the feasibility of such an approach. Methods: 2-10 mm esophageal carcinoma fragments obtained from resected patient tumors were implanted directly into NOD/SCID mice. Tumors that grew beyond 1.5 cm in diameter were passaged serially. Pathologic properties were assessed from passage to passage. Potential clinicopathological predictors of engraftment were evaluated. Results: Of the 63 patients with tumors used for implantation, 67% were male; median age 66 (range 31-89); 31% node negative disease; 69% node positive disease; 12% metastatic; 55% received neoadjuvant therapy; 12% had prior Barrett's esophagus; 46% had pre-existing heartburn; 88% were distal esophageal/GE junction cancers. Engraftment occurred in 14/43 (33%) adeno-, 1/14 (7%) squamous, and 1/1 adenosquamous carcinomas (p=0.05; 5 others were rare tumors e.g. granular or small cell). Engraftment occurred in 6/31 well/moderately vs 7/18 poorly differentiated tumors (p=0.08). Because we amended our implantation procedures, we compared engraftment rates pre- (7/39; 18%) and post-amendment (8/23; 35%; p=0.13). The primary architecture of the xenografted tissue remained similar pathologically for up to 5+ passages. None of the following variables predicted for engraftment (p>0.20 each comparison): cancer location, age, gender, history of heartburn, pre-operative therapy, presence of Barrett's esophagus, disease stage, or recurrence of primary cancer. Conclusions: Creation of esophageal cancer xenografts from primary human resected specimens is feasible. Adenocarcinomas, higher tumor grade, and newer implantation strategies were associated with improved engraftment. We are treating these models with chemotherapy to discover new pharmacogenomic predictive biomarkers. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,166
Tête enseignante GPT0,468
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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