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Enregistrement W2588047006 · doi:10.1161/circgenetics.116.001537

Novel Variant in the <i>ANK2</i> Membrane-Binding Domain Is Associated With Ankyrin-B Syndrome and Structural Heart Disease in a First Nations Population With a High Rate of Long QT Syndrome

2017· article· en· W2588047006 sur OpenAlexaffabout
Leigh Anne Swayne, Nathaniel P. Murphy, Sirisha Asuri, Lena W. Chen, Xiaoxue Xu, Sarah McIntosh, Chao Wang, Peter J. Lancione, Jason D. Roberts, Charles R. Kerr, Shubhayan Sanatani, Elizabeth D. Sherwin, Crystal F. Kline, Mingjie Zhang, Peter J. Mohler, Laura Arbour

Notice bibliographique

RevueCirculation Cardiovascular Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of VictoriaUniversity of British ColumbiaWestern University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésAnkyrinLong QT syndromeSudden deathBiologyGeneticsMutationQT intervalInternal medicineMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background— Long QT syndrome confers susceptibility to ventricular arrhythmia, predisposing to syncope, seizures, and sudden death. While rare globally, long QT syndrome is ≈15× more common in First Nations of Northern British Columbia largely because of a known mutation in KCNQ1 . However, 2 large multigenerational families were affected, but negative for the known mutation. Methods and Results— Long QT syndrome panel testing was carried out in the index case of each family, and clinical information was collected. Cascade genotyping was performed. Biochemical and myocyte-based assays were performed to evaluate the identified gene variant for loss-of-function activity. Index cases in these 2 families harbored a novel ANK2 c.1937C>T variant (p.S646F). An additional 16 carriers were identified, including 2 with structural heart disease: one with cardiomyopathy resulting in sudden death and the other with congenital heart disease. For all carriers of this variant, the average QTc was 475 ms (±40). Although ankyrin-B p.S646F is appropriately folded and expressed in bacteria, the mutant polypeptide displays reduced expression in cultured H9c2 cells and aberrant localization in primary cardiomyocytes. Furthermore, myocytes expressing ankyrin-B p.S646F lack normal membrane targeting of the ankyrin-binding partner, the Na/Ca exchanger. Thus, ankyrin-B p.S646F is a loss-of-function variant. Conclusions— We identify the first disease-causing ANK2 variant localized to the membrane-binding domain resulting in reduced ankyrin-B expression and abnormal localization. Further study is warranted on the potential association of this variant with structural heart disease given the role of ANK2 in targeting and stabilization of key structural and signaling molecules in cardiac cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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